旷工开除扣工资是否合法，需分情况讨论，以下是具体分析：
一、合法扣工资的情况
公司规章制度明确且合法
- 合法性基础：若公司的规章制度中明确规定旷工属于严重违反规章制度的行为，并规定相应的处罚措施（如扣除一定金额的工资），且该规章制度经过民主程序制定（如经职工代表大会讨论、与工会协商确定等），并已向员工公示或告知，则公司在员工旷工时依据此制度进行扣工资处理是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。同时，如果劳动合同中有明确约定旷工应扣除的工资或奖金等条款，且这些条款不违反法律法规的强制性规定，那么公司也有权按照合同约定执行。
劳动者给用人单位造成经济损失
- 扣除原则：依据《工资支付暂行规定》第十六条，若劳动者因本人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按劳动合同约定要求其赔偿。赔偿金额可从劳动者工资中扣除，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%。若扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 示例：员工旷工导致公司重要项目延误，给公司造成经济损失，且劳动合同中有相关赔偿约定，则公司可按规定从其工资中扣除相应赔偿，但需注意扣除比例和最低工资标准。
二、不合法扣工资的情况
公司规章制度不明确或不合法的情形
- 缺乏制度支持：若公司没有明确的规章制度规定旷工应扣除工资，或者规章制度未经过民主程序制定、未向员工公示或告知，则公司无权随意扣除员工的工资。
- 法律限制：即使员工旷工给公司造成了损失，公司也不能随意扣除其全部或部分工资作为罚款，而必须遵循法律规定的限度和程序，如每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
扣除工资超过法定限额
- 超额扣除：即使因劳动者原因造成经济损失而扣工资，若每月扣除部分超过当月工资的20%，或扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，这种扣除方式也是不合法的。
三、劳动者权益保护
若劳动者认为用人单位开除时扣工资的行为不合法，可采取以下措施维护自己的合法权益：
- 协商解决：首先尝试与用人单位进行协商，寻求和解。
- 投诉举报：协商不成时，可向当地劳动监察部门投诉举报，请求查处用人单位的违法行为。
- 申请劳动仲裁：若投诉举报未能解决问题，劳动者可依法向劳动仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径维护自己的权益。
总结来说，旷工开除扣工资是否合法，主要取决于公司规章制度是否合法有效、劳动合同是否有相关约定以及扣除工资是否符合法律规定。劳动者应了解自己的权益，并在遇到不合法扣工资行为时采取适当措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。