农民工面对工资被拖欠两年的问题，应积极主动采取多种措施来维护自身合法权益，工资拖欠两年以上并不会自动失效，但可能会因超过诉讼时效而面临维权困难，不过仍可通过合法途径追讨。以下是从不同角度给出的详细分析和建议：

一、法律时效规定

1. 诉讼时效：根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，如果农民工的工资被拖欠两年以上，且在此期间未采取任何法律手段主张权利，虽然债务本身并未消失，但可能因超过诉讼时效而丧失胜诉权。然而，这并不意味着完全无法追讨，只是维权难度可能增加。

2. 仲裁时效：劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。但值得注意的是，对于拖欠劳动报酬的情况，如果劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议，劳动者申请仲裁不受这一年的仲裁时效期间的限制；劳动关系终止后，则应在一年内提出仲裁申请。

二、应对策略

1. 收集证据：

   • 劳动合同、工资条、考勤记录等能够证明劳动关系和工资拖欠事实的材料。
   • 与雇主沟通协商的记录，如短信、邮件、录音等。
   • 其他相关证据，如证人证言、银行转账记录等。

2. 与雇主协商：

   • 尝试与雇主进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。这有助于维护双方的关系，并可能更快地解决问题。

3. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，要求其对雇主的违法行为进行调查和处理。劳动监察部门有权责令雇主支付拖欠的工资，并可能对其处以罚款等行政处罚。

4. 申请劳动仲裁：

   • 在收集到足够证据后，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会将依法进行裁决，如果裁决支持农民工的请求，雇主应履行支付义务。

5. 提起诉讼：

   • 如果对仲裁结果不满意或在法定期限内未收到仲裁裁决书，可以向人民法院提起诉讼。法院将根据事实和法律规定作出判决，判决生效后雇主仍不支付的，可申请强制执行。

三、特殊情况处理

1. 不可抗力或其他正当理由：

   • 如果在诉讼时效期间的最后六个月内，因不可抗力或其他正当理由（如重大疾病、自然灾害等）导致农民工无法行使请求权，那么诉讼时效将中止。自中止时效的原因消除之日起满六个月，诉讼时效期间届满。

2. 债务人同意履行义务：

   • 如果雇主在诉讼时效期间届满后同意履行支付工资的义务，那么不得以诉讼时效期间届满为由抗辩。此时，农民工仍可以依法追究雇主的法律责任。

四、实际操作建议

• 尽快行动：时间拖得越久，追讨难度可能越大。因此，一旦发现工资被拖欠，应尽快采取行动。
• 保留证据：务必妥善保管所有与劳动关系和欠薪相关的证据和文件，这是维权的关键。
• 寻求帮助：在维权过程中，可以寻求工会组织、政府部门、法律援助机构或社会组织的帮助和支持。

示例：假设农民工小李的工资被拖欠了两年，他首先收集了劳动合同、工资条和与雇主的沟通记录等证据。然后，他尝试与雇主协商，但未能达成一致。接着，他向当地的劳动监察部门投诉，并提交了相关证据。劳动监察部门调查后，责令雇主支付拖欠的工资。如果雇主仍不支付，小李还可以进一步申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的权益。

综上所述，农民工面对工资被拖欠两年的问题时，应综合运用多种途径来维护自身权益。通过协商、投诉、仲裁、诉讼等方式，结合工会、政府和社会各界的帮助，可以有效解决工资拖欠问题，保障劳动者的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。