收到公司寄回的三方协议后，核心处理步骤如下：

1. 核对协议内容是否与签署版本一致
   重点检查协议中的关键条款（如岗位、薪资、工作地点、报到时间、违约责任等）是否与之前签署的版本完全一致。若发现公司单方面修改了核心条款（例如降低薪资、变更岗位），需立即联系公司人力资源部门确认修改原因及合法性。根据《民法典》第四百七十条，合同修改需双方协商一致，单方修改不产生法律效力。

2. 确认协议是否已加盖公司公章
   若公司寄回的协议未加盖公章或公章模糊不清，需要求公司重新寄送加盖清晰公章的协议。根据《民法典》第四百九十条，合同自双方签字或盖章时成立，未盖章的协议可能被认定为未生效。

3. 签署并回寄协议（如需）
   若协议内容无误且已加盖公章，需按照公司要求的时间节点签署协议（通常需本人签字并注明日期），并通过EMS或顺丰等可追溯的快递方式回寄给公司，保留寄送凭证。若公司要求扫描件先行确认，需在回寄原件前要求公司出具书面确认函，避免后续纠纷。

4. 留存协议副本及沟通记录
   将签署后的协议扫描存档，并保存与公司沟通的邮件、短信、微信等记录。若后续公司未履行协议（如拒绝接收报到、擅自变更条款），这些证据将作为维权依据。根据《劳动争议调解仲裁法》第六条，发生劳动争议时，当事人需对自己的主张提供证据。

特殊情形处理：

• 若公司寄回的协议与之前版本差异过大（例如新增违约金条款、服务期条款），需谨慎签署。此类条款可能涉及《劳动合同法》第二十二条至第二十五条的约束，例如服务期条款需以公司提供专项培训费用为前提，违约金数额不得超过培训费用。
  
• 若公司拒绝寄回协议或拖延处理，可通过书面函件（EMS邮寄）催告公司履行义务，并明确告知若逾期未处理将视为公司放弃签署协议，保留追究其责任的权利。
  

后续建议：
签署三方协议后，建议定期与公司人力资源部门确认报到流程及所需材料，避免因信息不对称影响入职。若对协议条款存在疑问，可直接向我咨询具体法律风险及应对方案。