核心结论：员工偷换店内收款码转走近10万元的行为已涉嫌刑事犯罪，同时涉及民事赔偿，用人单位需通过刑事报案、民事追偿、内部管理整改三方面处理。以下是具体分析：
一、刑事责任层面：已涉嫌盗窃罪，必须立即报案
根据《刑法》第264条，以非法占有为目的，秘密窃取公私财物数额较大的（一般3000元至1万元以上为“数额较大”），构成盗窃罪。本案中：
- 行为定性：员工通过偷换收款码的方式，将本应进入公司账户的资金转移至个人账户，属于“秘密窃取”行为；
- 数额标准：半年转走10万元，远超过“数额巨大”（一般3万元至10万元以上）的标准，可能面临3年以上10年以下有期徒刑；
- 操作建议：
- 立即固定证据：保存收款码被替换的监控录像、转账记录、员工工作记录等；
- 向公安机关报案：提交证据材料，要求立案侦查；
- 配合调查：如实陈述案件事实，协助追缴赃款。
二、民事责任层面：可要求员工全额赔偿损失
根据《民法典》第1165条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。本案中：
- 赔偿范围：公司可要求员工返还全部非法所得（10万元），并赔偿因资金被占用导致的利息损失或其他直接经济损失；
- 操作建议：
- 在刑事报案的同时，可同步提起民事诉讼，要求员工赔偿损失；
- 若员工已将赃款挥霍，可申请法院强制执行其名下财产（如房产、车辆、银行存款等）；
- 若员工无力赔偿，可申请将其纳入失信被执行人名单，限制其高消费行为。
三、内部管理层面：需立即整改，避免再次发生
- 收款码管理：
- 每日核对收款记录与实际到账金额，发现异常立即排查；
- 采用“动态收款码”（如每笔交易生成独立二维码）或“双码核对”（同时设置微信、支付宝收款码并定期比对）；
- 限制收款码的打印权限，仅允许财务或指定人员操作。
- 员工监督：
- 加强财务流程审计，定期检查资金流向；
- 对涉及资金操作的关键岗位（如收银员、出纳）进行背景调查和定期轮岗；
- 签订《廉洁承诺书》，明确违规后果。
- 法律培训：
- 组织员工学习《刑法》《治安管理处罚法》中关于盗窃、诈骗的规定；
- 强调公司规章制度，明确“偷换收款码”属于严重违纪行为，可立即解除劳动合同且不支付经济补偿。
四、特殊情形提醒：若员工拒不认罪或赃款已转移
- 证据收集：除监控和转账记录外，可调取员工手机通讯记录、社交软件聊天记录，证明其主观故意；
- 刑事附带民事诉讼：若刑事案件尚未审结，可在刑事诉讼中同步提起附带民事诉讼，要求赔偿；
- 第三方责任：若收款码平台（如微信、支付宝）存在安全漏洞导致被替换，可尝试追究平台责任（但实践中难度较大，需具体分析）。
总结：本案需以刑事报案为核心，同步推进民事赔偿和内部整改。建议尽快行动，避免证据灭失或赃款被进一步转移。如有其他细节需要补充（如员工是否在职、赃款去向等），可进一步沟通，我会为你提供更具体的操作方案。