商铺改公寓是否合法，需综合考虑多个因素，只有在满足相关法定条件和程序的前提下，此类改造才是合法的。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、规划与用途变更
查看原始规划：首先，需要确认商铺的原始规划用途是否为商业，并查阅相关规划文件或产权证以明确其规划用途。若原始规划明确为商业用途，且法律未明确禁止改为公寓，则改造在规划层面可能具有可行性。但需注意，即便法律未明确禁止，也需进一步考虑其他因素。
规划部门审批：根据《中华人民共和国城乡规划法》的相关规定，任何对房屋使用性质的变更均需向城市、县人民政府城乡规划主管部门提出申请，并获得批准。未经批准擅自变更用途，将构成违法建设行为，可能面临责令停止施工、恢复原状，甚至被拆除和罚款的处罚。
二、建筑安全与结构稳定性
结构安全评估：商铺与公寓在建筑结构设计上存在差异，改造前需进行专业的结构安全评估，确保改造不会破坏建筑物的整体安全性能。若改造过程中随意拆除承重墙或进行其他影响结构安全的行为，将违反《建设工程质量管理条例》等法律法规，面临法律责任。
消防安全要求：不同用途的建筑有不同的消防设计和设施配置要求。改造时需按照公寓的消防要求进行改造和配置消防设施，如增设烟雾报警器、喷淋系统等，确保符合《中华人民共和国消防法》的规定。若改造后的建筑未达到居住建筑的消防及安全标准，存在严重安全隐患的，相关部门同样有权责令整改，直至达到安全标准为止。
三、环保与其他相关规定
环保要求：商铺改公寓还需满足居住环境的环保标准，如噪音限制、污水处理等。若改造后产生的污染物超过居住环境排放标准，将违反《中华人民共和国环境保护法》等相关法律法规，可能面临环保部门的处罚。
物业管理规定：改造还需考虑小区物业管理规定和业主公约的约束。通常需经过物业管理公司同意，并遵守物业管理的相关规定。若改造行为违反了物业管理规定或业主公约，可能面临恢复原状、承担违约责任等后果。
四、城市规划与土地使用规定
符合城市规划：改造需符合城市整体规划，不得破坏原有的规划布局，影响周边居民的生活质量和城市的整体形象。若改造行为与城市规划相悖，可能面临规划部门的处罚。
土地使用规定：需确保改造后的公寓用途符合土地使用规定。若土地使用性质不符，如将商业用地改为居住用地，可能引发法律问题，面临土地管理部门的处罚。
五、实际操作建议
咨询相关部门：在进行商铺改公寓的改造前，建议先咨询当地的规划部门、消防部门、环保部门以及物业管理公司，了解具体的法律规定和程序要求。
专业评估与改造：聘请专业的建筑师和结构工程师进行结构安全评估和改造设计，确保改造后的建筑符合安全标准。同时，按照公寓的消防要求进行改造和配置消防设施。
办理相关手续：在获得相关部门审批后，及时到不动产登记部门办理产权用途变更登记手续，确保房屋的产权性质与实际用途相符。
总结来说，商铺改公寓的合法性取决于是否满足了一系列法定条件和程序。若未满足这些条件，则改造行为可能构成违法。因此，在进行此类改造前，务必进行充分的调查和咨询，确保改造行为的合法性与合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。