特殊工时制度是针对因工作性质或生产特点无法实行标准工时制度的劳动者所设立的一种灵活工时制度。它主要包括不定时工作制和综合计算工时工作制两种类型，下面我将从这两个方面为你详细解释：
一、不定时工作制
定义及适用范围：
- 不定时工作制是指因工作性质、特点或工作职责的限制，无法按标准工作时间衡量或是需要机动作业的职工所采用的工作时间制度。这种制度下，劳动者没有固定的上下班时间限制，工作时间和地点相对灵活。
- 它适用于企业中的高级管理人员、外勤人员、推销人员、部分值班人员、长途运输人员、出租汽车司机、铁路、港口、仓库的部分装卸人员以及其他因工作无法按标准工作时间衡量的职工。
法律要求与劳动者权益：
- 实行不定时工作制需经劳动行政部门审批，未经审批不得擅自实行。
- 企业应根据标准工时制度合理确定劳动者的劳动定额或其他考核标准，并安排劳动者休息，确保劳动者的身体健康。
- 劳动者的工资由企业按照本单位的工资制度和分配办法，根据实际工作时间和完成劳动定额情况计发。
- 劳动者享受带薪年休假、婚丧假、产假等假期，这些假期的享受不受日延长工作时间标准和月延长工作时间标准的限制，但用人单位应确保劳动者的休息休假权利。
二、综合计算工时工作制
定义及适用范围：
- 综合计算工时工作制是指因工作性质特殊或受季节及自然条件限制，需在一段时间内连续作业，采取以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。
- 它适用于交通、铁路、邮电、水运、航空、渔业等行业中需连续作业的职工，以及地质及资源勘探、建筑、制盐、制糖、旅游等受季节和自然条件限制的行业的部分职工。
法律要求与劳动者权益：
- 实行综合计算工时工作制同样需经劳动行政部门审批。
- 其工作时间计算周期可以是周、月、季、年，但平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。超过部分视为延长工作时间，用人单位应依法支付加班工资。
- 用人单位应确保劳动者的休息休假权利，合理安排劳动者的工作和休息时间。
三、特殊工时制度下的加班与工资支付
- 在特殊工时制度下，加班时间同样遵循一般的加班时间规定标准，即每日工作时间不超过8小时，每周工作时间不超过40小时（在综合计算周期内平均计算）。
- 在正常工作日内，如需延长工作时间，一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长的，每日不得超过3小时，每月不得超过36小时。但在特定情形下（如自然灾害、事故抢修等），加班时间可不受此限制。
- 用人单位应依法支付加班工资，具体标准根据加班时间和工资基数确定。对于不定时工作制的职工，不执行加班工资的规定（但法定节假日工作的仍需支付加班工资）；对于综合计算工时工作制的职工，在综合计算周期内超过法定标准工作时间的部分应视为延长工作时间，并支付相应的加班工资。
总结：特殊工时制度是一种灵活的工时安排，旨在满足不同行业和工作性质的特殊需求。企业在实施过程中应严格遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益得到充分保障。如果你对特殊工时制度还有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。