结论：借3000元而收取900元担保费是否合法，不能一概而论，需结合具体法律规定和合同条款来判断。以下从多个角度进行分析：
一、担保费合法性的基本判断
法律规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，担保费的收取需遵循公平、自愿、合法和诚实信用的原则。担保费的具体金额或比例，法律并未作出统一规定，而是由当事人自行协商确定。
- 如果担保费的收取明显过高，超出了合理范围，可能构成不公平交易，甚至可能涉及高利贷等违法行为。
合同条款：
- 担保费的合法性还取决于借款合同和担保合同中的具体条款。如果合同中明确约定了担保费的金额或比例，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么担保费的收取就是合法的。
- 如果合同中没有明确约定担保费，或者约定不明确，那么担保费的收取就可能存在争议。
二、担保费合理性的判断
市场行情：
- 担保费的合理性可以参考市场行情。如果900元担保费相对于3000元借款来说过高，超出了当地同类担保服务的平均水平，那么该担保费就可能被认为是不合理的。
风险评估：
- 担保费的收取也应与担保机构承担的风险相匹配。如果担保机构为借款人提供了较高的担保额度或承担了较大的风险，那么收取较高的担保费可能是合理的。
- 反之，如果担保机构承担的风险较小，或者提供的担保额度较低，那么收取过高的担保费就可能缺乏合理性。
三、具体计算与判断（若涉及具体比例）
- 计算公式（假设以比例形式判断）：若以担保费占借款本金的比例来衡量，则比例为 \(\frac{900}{3000} \times 100\% = 30\%\)。
- 判断标准：这个比例是否合理，需结合当地市场行情、担保机构的风险承担能力、借款人的信用状况等多方面因素进行综合判断。一般来说，如果担保费比例过高，可能引发合法性争议。
四、建议与风险提示
审查合同条款：
- 在签订借款合同和担保合同时，务必仔细审查合同条款，特别是关于担保费的约定。确保合同条款明确、合法，并且符合自己的利益。
咨询专业人士：
- 如果对担保费的合法性或合理性存在疑问，建议咨询专业律师或金融顾问。他们可以根据具体情况提供法律意见或建议，帮助你维护自己的合法权益。
警惕高利贷：
- 如果担保费的收取明显过高，甚至接近或超过借款本金的一定比例（如年利率36%以上，根据最新规定可能有所不同），那么应警惕可能涉及高利贷等违法行为。在这种情况下，应坚决拒绝支付过高的担保费，并考虑向相关部门举报。
总结：借3000元而收取900元担保费是否合法，需结合具体法律规定、合同条款、市场行情和风险评估等多方面因素进行综合判断。如果你对此存在疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。