结论：关于“借6000元担保费1000元是否合法”的问题，不能一概而论，需要从多个角度进行分析，包括担保费的性质、是否超过法定利率上限以及是否违反相关法律法规等。

分析角度一：担保费的性质

1. 合法担保费：如果担保费是作为借款合同的一部分，且双方明确约定了担保费的性质和金额，同时该担保费并未超过法定利率上限（目前，民间借贷利率的司法保护上限为一年期贷款市场报价利率的四倍），那么这样的担保费是合法的。在这种情况下，担保费可以视为借款人为了获得贷款而支付的一种成本或费用。

2. 非法担保费（变相高利贷）：如果担保费实际上是一种变相的高利贷，即出借人通过收取高额担保费的方式，使得借款人实际承担的利率超过了法定上限，那么这样的担保费就是非法的。在这种情况下，借款人可以依据相关法律法规，请求法院或仲裁机构确认超出部分的利息无效。

分析角度二：是否超过法定利率上限

• 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，民间借贷利率的司法保护上限为一年期贷款市场报价利率的四倍。如果担保费加上借款利息的总和超过了这一上限，那么超出部分将不受法律保护。

分析角度三：是否违反相关法律法规

• 除了利率上限外，还需要考虑担保费是否违反了其他相关法律法规。例如，如果担保费的收取方式、时间或条件等违反了《民法典》中关于借款合同的规定，或者涉及欺诈、胁迫等违法行为，那么这样的担保费也是非法的。

具体建议：

1. 核实合同条款：首先，借款人应仔细审查借款合同中的条款，特别是关于担保费的约定。确保担保费的性质、金额和支付方式等明确无误，并符合相关法律法规的规定。

2. 计算实际利率：借款人可以计算一下自己实际承担的利率（包括借款利息和担保费），看是否超过了法定上限。如果超过了，可以与出借人协商降低利率或调整担保费金额。

3. 寻求法律帮助：如果借款人认为担保费非法或存在争议，可以寻求专业律师的帮助。律师可以根据具体情况提供法律意见，并帮助借款人维护自己的合法权益。

示例说明：

假设借款人借款6000元，约定借款期限为一年，年利率为10%（未超过法定上限），同时约定担保费为1000元。在这种情况下，如果担保费被视为借款成本的一部分，且借款人实际承担的年利率（包括借款利息和担保费分摊到每年的部分）未超过法定上限，那么这样的担保费是合法的。但如果担保费使得借款人实际承担的年利率超过了法定上限，那么超出部分将不受法律保护。

后续行动建议：

• 如果您对担保费的合法性存在疑问，或者认为担保费过高或存在争议，请直接向我咨询。我可以根据您的具体情况提供详细的法律意见，并帮助您制定合适的解决方案。