公司规定不允许抽烟，这一规定本身是合法的，但公司无权直接对员工进行罚款。以下从多个角度为你详细分析：
公司禁烟规定的合理性
公司为了维护工作环境和员工健康，制定禁止抽烟的规定是完全合理的。吸烟不仅有害个人健康，还可能对周围同事造成不良影响，如二手烟的危害等。因此，从维护公共利益和职场环境的角度出发，禁烟规定具有正当性。
公司罚款行为的合法性
公司无行政处罚权：罚款本质上是一种行政处罚行为。根据《行政处罚法》的相关规定，只有具有行政处罚权的行政机关和法律、法规授权的具有管理公共事务职能的组织，在法定职权范围内才能实施行政处罚。公司作为普通的民事主体，并不具备行政处罚权，因此无权对员工进行罚款处罚。
劳动法律法规的限制：根据《劳动合同法》等劳动法律法规，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者的合法权益。在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，如劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生等，应当经过职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。罚款这种直接扣减劳动者工资报酬的做法，不符合法律规定，法律严格限制用人单位随意克扣劳动者工资，以保护劳动者的经济权益。
合法的管理方式
尽管公司不能通过罚款来管理员工抽烟行为，但可以采取其他合理、合法的方式进行管理。例如：
警告、记过等纪律处分：公司可以根据内部规章制度，对违规抽烟的员工给予警告、记过等纪律处分，以起到警示作用。
解除劳动合同：在严重违反公司规章制度或法律法规的情况下，公司有权解除与员工的劳动合同。但这一措施应当谨慎使用，并确保符合法律法规的规定。
员工权益保护与应对措施
如果员工因抽烟被公司罚款，可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
与公司沟通：首先，员工应与公司进行沟通，指出罚款行为缺乏法律依据，并要求公司退还罚款。
向劳动监察部门投诉：若沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司改正不当行为。
通过法律途径维权：员工还可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自身的合法权益。
特殊情况下的经济损失赔偿
如果员工在禁止抽烟的区域抽烟，给公司造成了实际经济损失（如引发火灾等），公司可以依据相关民事法律规定和劳动合同要求员工进行赔偿。但赔偿数额应仅限于补偿公司因员工抽烟行为所遭受的实际损失，并且公司需要提供充分的证据证明损失的存在以及损失与员工抽烟行为之间的因果关系。这与罚款性质截然不同，罚款是惩罚性的，而赔偿则是补偿性的。
总结：公司规定不允许抽烟是合法的，但公司无权直接对员工进行罚款。如果员工因抽烟被罚款，应采取适当的措施来维护自己的合法权益。同时，员工也应自觉遵守公司的禁烟规定，共同营造一个良好的工作环境。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。