结论前置：劳动合同、劳务合同等涉及身份关系的合同不适用某些特定法律规定（如《民法典》合同编中一般合同的规定），但这并不意味着其补充协议也完全不适用这些规定。补充协议的适用性主要取决于其内容是否涉及身份关系以及具体法律规定。

1. 身份关系合同与补充协议的基本区别

• 身份关系合同：如劳动合同、劳务合同，这些合同主要调整的是基于特定身份关系（如劳动关系）产生的权利义务。它们受到劳动法律法规的特别调整，如《劳动法》、《劳动合同法》等，这些法律对劳动合同的签订、履行、变更、解除等都有详细规定。
• 补充协议：补充协议通常是对原合同中未约定或约定不明确的事项进行补充或修改的协议。其内容可能涉及原合同的各个方面，包括但不限于身份关系、经济条款、违约责任等。

2. 补充协议的适用性分析

• 若补充协议内容不涉及身份关系：例如，补充协议仅对原合同中的经济条款（如工资、奖金、福利待遇等）进行修改或补充，且这些修改或补充不违反劳动法律法规的强制性规定，那么该补充协议通常是有效的，并适用《民法典》合同编中关于合同变更、履行等的一般规定。
• 若补充协议内容涉及身份关系：例如，补充协议试图改变原劳动合同中的劳动关系性质、工作时间、休息休假等涉及劳动者基本权益的条款，且这些改变违反了劳动法律法规的强制性规定，那么该补充协议可能是无效的。因为身份关系合同受到特别法律的调整，其变更必须遵循这些特别法律的规定。

3. 具体法律规定与案例参考

• 法律规定：根据《劳动合同法》等相关法律法规，劳动合同的变更必须遵循平等自愿、协商一致的原则，且不得违反法律、行政法规的强制性规定。补充协议作为劳动合同的一部分，也必须遵循这些原则。
• 案例参考：在实际司法实践中，法院或仲裁机构在审理涉及劳动合同补充协议的纠纷时，会综合考虑补充协议的内容、原劳动合同的约定以及相关法律法规的规定，来判断补充协议的效力。如果补充协议的内容合法、合理且不违反原劳动合同的约定和法律法规的强制性规定，那么该补充协议通常会被认定为有效。

4. 法律建议

• 在签订补充协议前：建议双方充分沟通、协商，确保补充协议的内容合法、合理且不违反原劳动合同的约定和法律法规的强制性规定。
• 在遇到纠纷时：如果双方对补充协议的效力产生争议，建议及时咨询专业律师，通过法律途径解决纠纷。律师可以根据具体情况分析补充协议的效力，并提供相应的法律建议。

总结：劳动合同、劳务合同等涉及身份关系的合同的补充协议是否适用相关法律规定，主要取决于补充协议的内容是否涉及身份关系以及具体法律规定。在签订和履行补充协议时，双方应遵循法律法规的规定，确保协议的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。