个人申请工伤认定后，相关的费用一般由工伤保险基金或用人单位承担，具体取决于费用的性质和工伤认定的结果。以下从不同角度为您详细分析：
一、工伤保险基金承担的费用
医疗费用：
- 根据《工伤保险条例》第三十条，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病进行治疗，享受工伤医疗待遇。治疗工伤所需费用符合工伤保险诊疗项目目录、工伤保险药品目录、工伤保险住院服务标准的，从工伤保险基金支付。
康复费用：
- 工伤职工到签订服务协议的医疗机构进行工伤康复的费用，符合规定的，同样从工伤保险基金支付。
辅助器具费用：
- 工伤职工因日常生活或者就业需要，经劳动能力鉴定委员会确认，可以安装假肢、矫形器、假眼、假牙和配置轮椅等辅助器具，所需费用按照国家规定的标准从工伤保险基金支付。
一次性伤残补助金和伤残津贴：
- 职工因工致残被鉴定为一级至十级伤残的，根据伤残等级，从工伤保险基金按伤残等级支付一次性伤残补助金。对于一级至四级伤残的职工，还按月支付伤残津贴。
一次性医疗补助金：
- 职工因工致残被鉴定为五级至十级伤残，与用人单位解除或者终止劳动合同时，由工伤保险基金支付一次性工伤医疗补助金。
二、用人单位承担的费用
停工留薪期工资：
- 职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
护理费：
- 生活不能自理的工伤职工在停工留薪期需要护理的，由所在单位负责。如果工伤职工已经评定伤残等级并经劳动能力鉴定委员会确认需要生活护理的，从工伤保险基金按月支付生活护理费。但在停工留薪期内，护理费通常由用人单位承担。
一次性伤残就业补助金：
- 职工因工致残被鉴定为五级至十级伤残，与用人单位解除或者终止劳动合同时，由用人单位支付一次性伤残就业补助金。
未参保情况下的全部费用：
- 如果用人单位未依法为职工缴纳工伤保险费，那么发生工伤事故后，所有应由工伤保险基金支付的费用，都将由用人单位承担。
三、特殊情况下的费用承担
第三人责任导致的工伤：
- 如果工伤是由第三人造成的，那么第三人应当承担相应的赔偿责任。同时，工伤职工也可以享受工伤保险待遇。但工伤保险基金在支付相关费用后，有权向第三人追偿。
未及时申请工伤认定的费用：
- 如果用人单位未在规定时间内提交工伤认定申请，那么在此期间发生的符合工伤保险条例规定的工伤待遇等有关费用，将由该用人单位负担。
总结与建议：
个人申请工伤认定后，费用的承担主要取决于费用的性质和工伤认定的结果。在大多数情况下，工伤保险基金将承担大部分费用，但用人单位仍需承担停工留薪期工资、护理费（停工留薪期内）、一次性伤残就业补助金等费用。如果用人单位未依法为职工缴纳工伤保险费，那么所有费用都将由用人单位承担。
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