申请工伤认定的费用一般由工伤保险基金承担，若单位未依法缴纳工伤保险，则由用人单位承担。以下是对这一问题的详细分析：
一、工伤保险基金承担的情况
根据《工伤保险条例》的相关规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。在申请工伤认定的过程中，所产生的费用，如鉴定费、检查费等，通常由工伤保险基金支付。这是工伤保险制度设计的一部分，旨在保障职工在遭受工伤时能够得到及时、有效的救治和补偿，同时减轻用人单位的负担。
二、用人单位承担的情况
未依法缴纳工伤保险：如果用人单位未依法为职工缴纳工伤保险费，那么在职工发生工伤时，用人单位就需要承担原本应由工伤保险基金支付的费用。这包括工伤认定的费用、工伤医疗费用、一次性伤残补助金等。这是用人单位未履行法定义务所应承担的法律责任。
逾期申请或未申请工伤认定：虽然《工伤保险条例》规定了用人单位应在一定期限内提出工伤认定申请，但如果用人单位逾期未申请或者未提出申请，那么在此期间发生的工伤待遇等有关费用，也可能需要由用人单位承担。不过，具体责任划分可能因地区和具体案情而有所不同，需要结合实际情况进行判断。
三、特殊情况下的费用承担
在某些特殊情况下，如职工与用人单位就是否为工伤存在争议，需要进行劳动仲裁或诉讼时，所产生的鉴定费、律师费等费用，可能需要根据仲裁或诉讼的结果来确定由谁承担。如果最终认定为工伤，且用人单位存在过错，那么这些费用可能由用人单位承担；如果未能认定为工伤，或者用人单位无过错，则可能需要由职工自行承担。
四、建议与提醒
及时申请工伤认定：对于职工来说，一旦发生工伤，应及时向用人单位报告，并要求用人单位在规定期限内提出工伤认定申请。如果用人单位未按时申请，职工或其近亲属也可以自行提出申请。
保留相关证据：在申请工伤认定的过程中，职工应保留好与工伤相关的所有证据，如医疗记录、事故现场照片、证人证言等。这些证据将有助于证明工伤事实，并保障职工的合法权益。
咨询专业律师：如果在工伤认定或赔偿过程中遇到任何问题或纠纷，建议及时咨询专业律师。律师将能够提供专业的法律意见和帮助，确保职工的权益得到充分保障。
希望以上分析能够对你有所帮助。如果你还有其他关于劳动工伤方面的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。