在综合计算工时工作制下，法定节假日的工资计算是一个涉及法律法规和具体操作细节的问题。以下是对这一问题的详细解答：

一、法定节假日工资计算的基本原则

根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，法定休假日安排劳动者工作的，用人单位应支付不低于工资的百分之三百（300%）的工资报酬。这一原则在综合计算工时工作制下同样适用。

二、具体计算方法

1. 确定加班工资基数：

   • 加班工资基数通常按劳动合同约定确定，且不得低于当地最低工资标准。若合同无明确约定，一般按劳动者本人正常劳动应得工资确定。

2. 计算法定节假日加班工资：

   • 法定节假日加班工资的计算公式为：加班工资 = 加班工资基数 ÷ 月计薪天数（21.75天）× 300% × 加班天数。
   • 例如，若劳动者月工资标准为6000元，国庆节（法定节假日）加班1天，则其加班工资为：6000 ÷ 21.75 × 300% × 1 ≈ 827.59元。

3. 法定节假日工作时间不计入综合计算周期：

   • 在综合计算工时工作制中，法定节假日的工作时间独立核算加班工资，不计入综合计算周期内的正常工作时间。这意味着，即使劳动者在法定节假日加班，这部分时间也不会被纳入综合计算周期的总工作时间中，以判断是否超时工作。

三、实例说明

以某企业实行季度综合工时制为例，季度法定标准工作时间为500小时。员工小李在该季度内正常工作时间累计480小时，另在国庆节（法定节假日）加班8小时。

• 小李的国庆节加班工资为：假设其小时工资为（月工资/21.75/8），则加班工资 = 小时工资 × 8 × 300%。具体数额需根据小李的实际月工资来计算。
• 这8小时的加班时间不计入小李该季度的500小时标准工作时间内，因此不会影响对其是否超时工作的判断。小李仍只需按正常工作时间工资标准获得480小时的工资，并额外获得国庆节的加班工资。

四、注意事项与合规要求

1. 确保加班工资基数的合法性：

   • 用人单位应确保加班工资基数的确定符合法律法规要求，不得低于当地最低工资标准，且应按劳动合同约定或劳动者本人正常劳动应得工资确定。

2. 遵守企业审批要求：

   • 企业实行综合计算工时工作制必须经劳动行政部门审批。未经审批擅自实行，即使与劳动者有约定，也可能被认定为无效，需按标准工时制支付加班工资。

3. 保障员工休息权利：

   • 员工在法定节假日享有休息权利，用人单位应合理安排工作时间，避免过度加班。若需安排员工在法定节假日工作，应依法支付加班工资，并确保员工的身心健康和合法权益得到保障。

综上所述，综合计算工时工作制下的法定节假日工资计算应遵循相关法律法规要求，确保加班工资基数的合法性、遵守企业审批要求，并保障员工的休息权利和加班补偿。用人单位在制定和执行综合计算工时工作制时，应严格遵守相关规定，维护员工权益，促进和谐劳动关系的发展。