结论前置：
- 劳动合同两份都在单位是不合法的，公司应依法将其中一份交付给劳动者。
- 若劳动者发现两份劳动合同都在单位，应积极采取行动维护自己的合法权益，包括与企业沟通、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁乃至向法院提起诉讼。
详细分析：
一、法律条款明确规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》第十六条的规定：“劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经用人单位与劳动者在劳动合同文本上签字或者盖章生效。劳动合同文本由用人单位和劳动者各执一份。”这一条款清晰界定了劳动合同文本的分配原则，即双方应各自持有一份，以确保合同的透明性和双方的权益。
二、法律目的与意义
要求用人单位和劳动者各执一份劳动合同的目的在于，保障劳动者能够充分了解并知晓劳动合同所约定的权利和义务。这样，在自身权益受到侵害时，劳动者可以依据手中的劳动合同来主张权利。同时，这也便于劳动行政部门等监管机构监督用人单位是否依法履行了劳动合同规定的义务。
三、法律后果与风险
- 对用人单位的行政处罚：若用人单位未将劳动合同文本交付给劳动者，即两份劳动合同都在公司手里，劳动行政部门有权责令用人单位改正。若经责令后仍不改正，劳动行政部门可进一步采取罚款等处罚措施。
- 赔偿责任：若因用人单位未提供劳动合同文本给劳动者，导致劳动者在涉及工资、福利待遇、工作时间、休息休假等方面的争议中无法提供证据而受损，用人单位需承担相应的赔偿责任。
- 劳动者权益受损：劳动者若没有持有劳动合同文本，在发生劳动纠纷时可能因缺乏直接证据而处于不利地位，难以有效维护自己的合法权益。
四、劳动者的应对措施
- 与企业友好沟通：首先尝试与企业的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确表达需要一份属于自己的劳动合同，并指出《劳动合同法》的相关条款。
- 准备充分的证据：在采取进一步行动之前，准备好能证明与企业存在劳动关系的材料，如工资支付记录、工作证、考勤记录等。
- 向劳动监察部门投诉：如果与企业沟通无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，提交准备好的证据材料，以便劳动监察部门能够迅速了解情况并作出处理。
- 申请劳动仲裁：若劳动监察部门的处理未能解决问题，或者劳动者对处理结果不满意，可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求企业交付劳动合同并承担相应的法律责任。
- 向法院提起诉讼：如果劳动者对劳动仲裁结果不服，还可以在规定的期限内向人民法院提起诉讼，通过法院的审判来最终维护自己的合法权益。
总结与建议：
劳动合同是保障劳动者与用人单位双方权益的重要文件，双方都应严格遵守《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定。作为劳动者，若发现两份劳动合同都在单位，应积极采取行动维护自己的合法权益。在整个过程中，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将为你提供专业、全面的法律服务。