从本地4S店购车但发票开在外地，以获取补贴的行为，在大多数情况下是存在风险的，并且可能违反相关法律法规。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律法规依据与合法性

1. 法律依据： 根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，纸质发票通常限于领用单位和个人在本省、自治区、直辖市内开具。这意味着，除非符合特定的特殊情形，否则异地开票是违法的。

2. 合法性分析： 虽然某些特殊情况下，如购车人有合理的经营或使用车辆需求，且符合税务机关对于发票开具的要求，异地开票可能被允许。但这种情况需要严格遵循相关税务规定和程序，否则就可能构成利用不同地区税收政策差异进行不正当税务筹划，如偷逃税款、虚开发票等，这将严重违反《中华人民共和国税收征收管理法》等相关法律法规，并可能面临补缴税款、滞纳金、高额罚款甚至刑事处罚等严重后果。

二、对购车人的影响与风险

1. 车辆登记与上牌： 不同地区对车辆购置税缴纳地点和上牌手续有不同规定。若发票开在外地，可能影响车辆在本地正常上牌，导致车辆无法上路行驶。

2. 售后维权： 异地发票可能导致售后维权困难。当车辆出现质量问题需要退换货或维修保养时，本地4S店可能会以发票不在本地为由，要求购车人提供更多额外的证明材料或处理流程更为繁琐。

3. 保险理赔： 保险公司可能关注发票开具地与车辆使用地等信息。异地发票在保险事故理赔时可能导致查勘、定损和理赔流程受阻，延长理赔时间或出现沟通不畅等问题。

4. 二手车交易： 异地发票可能影响车辆的二手市场价值。潜在买家可能对车辆来源、车况等存疑，从而影响车辆的受欢迎程度和保值率。

三、应对建议与风险防范

1. 购车前咨询： 在购车前，务必向4S店详细了解将发票开在外地的具体原因及对车辆上牌、售后、保险等方面可能产生的影响。确保自己的合法权益得到保障，并与4S店明确责任和义务。

2. 研究政策法规： 仔细研究本地和发票开具地关于车辆相关的政策法规，特别是关于车辆上牌、购置税缴纳、售后维修等方面的规定，提前做好应对准备。

3. 选择正规渠道： 尽量选择信誉良好、合规经营的4S店进行购车，避免因追求低价而陷入非法或不合规的交易中。

4. 及时沟通解决： 如果遇到异地开票问题，应及时与4S店沟通解决。必要时，可寻求法律途径维护自己的合法权益，并保留好所有相关证据和文件。

综上所述，从本地4S店购车但发票开在外地以获取补贴的行为是存在风险的，并且可能涉及违法行为。因此，我建议您在购车过程中严格遵守相关法律法规和规定，确保发票的合法性和有效性，以维护自身的合法权益和避免潜在的风险。