关于车辆挂靠在物流公司名下所收挂靠费的合法性及收费时间问题，以下是我的详细解答：
挂靠费的合法性：
- 合法性基础：车辆挂靠经营在物流行业中是一种常见的经营模式，其中物流公司作为被挂靠单位，为挂靠车辆提供运营资质、管理服务等，并收取一定的挂靠费用。这种费用在双方自愿、平等、公平的基础上，通过签订挂靠协议明确约定，通常是合法的。
- 法律依据：虽然直接的法律法规可能并未明确提及“挂靠费”的合法性，但根据《中华人民共和国民法典》中关于合同自由、公平原则的规定，只要双方签订的挂靠协议不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方意思表示真实，那么该协议及其中约定的挂靠费就是合法的。
收费时间的确定：
- 协议约定优先：挂靠费的收费时间应首先遵循双方签订的挂靠协议中的约定。如果协议中明确规定了挂靠费是提前缴纳还是满一年收取，那么双方应按照协议约定执行。
- 常见收费模式：
- 提前缴费：一些物流公司可能要求挂靠车辆在运营开始前或每年初提前缴纳挂靠费，以确保车辆能够持续获得运营资质和管理服务。
- 满一年收取：也有物流公司选择在挂靠车辆运营满一年后收取挂靠费，这种模式可能更侧重于对车辆实际运营情况的考量。
- 无约定时的处理：如果挂靠协议中未明确约定收费时间，双方应协商确定。在协商无果的情况下，可以参照行业惯例或相关法律法规的规定进行处理。但需要注意的是，由于直接针对挂靠费收费时间的法律法规可能并不明确，因此行业惯例和双方协商将成为主要依据。
法律建议：
- 明确协议条款：在签订挂靠协议时，双方应明确约定挂靠费的金额、收费时间、支付方式等关键条款，以避免后续产生纠纷。
- 保留相关证据：无论是提前缴费还是满一年收取，双方都应保留好相关的缴费凭证和协议文本等证据，以备不时之需。
- 及时沟通协商：如果在挂靠经营过程中出现关于挂靠费的争议或问题，双方应及时沟通协商，寻求妥善解决方案。
总结来说，车辆挂靠在物流公司名下所收的挂靠费在双方自愿、平等、公平的基础上通过签订挂靠协议明确约定是合法的。收费时间应首先遵循协议约定，无约定时双方应协商确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。