结论：工人离职多年后查出其在职期间有偷东西行为，处理方式需根据具体情况来定，包括是否已过追诉时效、公司规章制度以及证据的充分性等因素。以下是从不同角度的详细分析：

1. 追诉时效问题：

   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪行为有追诉时效的限制。对于一般的盗窃行为，如果数额不大，可能不构成犯罪，而属于违反治安管理的行为，此时应依据《中华人民共和国治安管理处罚法》处理，该法规定的追诉时效为六个月。若超过此期限，公安机关可能不再予以处罚。
   • 如果盗窃行为构成犯罪，如盗窃罪，那么追诉时效将根据犯罪的严重程度而定，可能从五年到二十年不等。但重要的是，如果自犯罪之日起超过一定年限（如二十年），且认为必须追诉的，需报请最高人民检察院核准。不过，在实际操作中，对于离职多年的员工，因其已不在公司控制范围内，且时间久远，追诉犯罪的难度极大。

2. 公司规章制度与劳动合同：

   • 公司应首先审查其内部的规章制度以及与员工签订的劳动合同，看是否有关于员工盗窃行为的处理规定。如果规章制度或劳动合同中明确规定了对于盗窃行为的处罚措施，如解雇、赔偿等，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可以依据这些规定来处理。
   • 但需要注意的是，如果员工已经离职多年，公司再依据之前的规章制度或劳动合同来追究其责任，可能会面临法律上的困难，特别是如果员工能够证明其离职时公司并未提出异议或已经放弃了追究的权利。

3. 证据的充分性：

   • 无论公司选择何种处理方式，都必须确保有充分的证据来证明员工的盗窃行为。这可能包括监控录像、证人证言、物品丢失记录等。如果证据不足或存在瑕疵，那么公司可能无法成功地追究员工的责任。
   • 此外，即使公司有充分的证据，也需要考虑证据的收集过程是否合法。如果证据是通过非法手段获得的，如非法搜查、窃听等，那么这些证据可能不会被法院采纳。

4. 实际处理建议：

   • 对于离职多年的员工，如果公司发现其在职期间有盗窃行为，且希望追究其责任，建议首先咨询专业律师，评估追诉的可行性和风险。
   • 如果决定追究责任，公司应尽可能收集充分的证据，并确保证据的收集过程合法合规。
   • 同时，公司也可以考虑与员工进行协商，看是否能够达成和解，如要求员工赔偿损失等。这种方式可能更为高效且成本较低。

后续行动建议：如果您作为公司方，面临此类情况，建议直接向我咨询，提供详细的案情和证据材料，以便我能够为您制定更具体的法律策略。如果您是员工方，且对此事有异议或需要法律帮助，也请随时向我提问，我将根据您的具体情况提供法律建议。