关于公司按照2540元作为公积金缴费基数是否合法的问题，这主要取决于您所在地区的具体政策规定。以下我将结合一般性的政策原则和您提供的参考信息，为您进行详细解答。

首先，我们需要明确的是，住房公积金的缴存基数通常是有上下限规定的。这些上下限的设定，旨在维护住房公积金制度的公平性，防止因缴存差距过大而引发不同行业、部门、单位之间职工收入分配差距的扩大，从而保障低收入职工的住房公积金合法权益。

1. 缴存基数下限的合法性：

   • 根据您提供的北京地区2025住房公积金年度缴存政策，自2025年9月1日起，住房公积金月缴存基数下限调整为2540元。这意味着，在北京地区，如果公司按照2540元作为公积金缴费基数，且该基数不低于当地最低工资标准（通常缴存基数下限会与最低工资标准挂钩或略高），那么这一做法是合法的。
   • 对于柳州地区，虽然您提供的政策解读中未直接提及2540元作为缴存基数下限，但柳州市区职工月最低工资标准为2200元，各县为1870元。若柳州地区也设定了类似的缴存基数下限，并且2540元不低于该下限（这需要根据柳州当地的具体政策来确定），那么公司按照2540元缴费也是合法的。不过，从您提供的信息来看，柳州地区的缴存基数下限似乎并未直接设定为2540元，而是与最低工资标准相关联。因此，在柳州地区，公司需确保缴费基数不低于当地公布的最低工资标准。

2. 缴存基数的其他要求：

   • 除了下限要求外，缴存基数通常还有上限要求，并且应基于职工上一年度的月平均工资来确定。公司应确保缴费基数既不超过上限，也不低于下限，并且真实反映了职工的工资水平。
   • 缴存比例也是影响公积金缴存额的重要因素。公司应根据自身情况在规定范围内（如5%至12%）自主确定具体缴存比例。

3. 合法性的综合判断：

   • 要判断公司按照2540元作为公积金缴费基数是否合法，需要综合考虑当地的具体政策规定、最低工资标准以及公司的实际情况。
   • 如果2540元不低于当地公布的住房公积金缴存基数下限，并且公司按照规定的缴存比例进行缴存，那么这一做法通常是合法的。

建议：

• 为了确保公司公积金缴存的合法性，建议您查阅当地住房公积金管理中心发布的最新政策文件，了解具体的缴存基数上下限和缴存比例要求。
• 如果您对公司的公积金缴存情况有疑问或担忧，可以向公司的人力资源部门或财务部门咨询，或者向当地住房公积金管理中心进行投诉和咨询。

综上所述，公司按照2540元作为公积金缴费基数是否合法，取决于当地的具体政策规定和最低工资标准。在符合当地政策要求的前提下，这一做法通常是合法的。