租集体的厂房自己投资加建是否合法，取决于是否满足一系列法定条件和程序。以下从多个角度进行详细分析：
一、合法加建的条件与程序
符合规划要求：
- 加建部分必须符合当地的土地利用总体规划、城乡规划以及年度计划，明确该地块可用于工业用途或允许建设厂房等经营性设施。若加建行为违反了土地利用总体规划或村庄规划，如将加建部分建在永久基本农田上，或不符合乡（镇）土地利用总体规划和村庄规划的要求，则属于违法建设。
办理相关审批手续：
- 建设工程规划许可：在加建前，需办理建设工程规划许可证，确保建设活动符合规划要求。这是加建行为合法性的关键步骤，未经许可擅自加建将构成违法行为。
- 村民会议同意：若加建行为涉及村集体土地，需经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或者三分之二以上村民代表的同意，体现集体决策的原则。
- 政府批准：相关申请需报乡（镇）人民政府或县级以上地方人民政府自然资源主管部门批准，确保建设行为得到官方认可。
签订合法有效的补充协议：
- 在加建前，应与村集体签订书面补充协议，明确加建部分的用途、租赁期限、租金支付方式及双方的权利义务等，以保障双方的合法权益。补充协议应作为原租赁合同的附件，具有同等法律效力。
二、不合法加建的情况及后果
未经审批擅自加建：
- 若未按照上述程序办理审批手续，擅自在租用的集体厂房上加建，将构成未经批准擅自建设的违法行为。相关部门将依法责令拆除违法建筑、恢复土地原状，并可处以罚款等行政处罚。
违反规划加建：
- 若加建行为违反了土地利用总体规划或村庄规划，同样属于违法建设。除了面临拆除和罚款等行政处罚外，还可能对企业的声誉和长期发展造成负面影响。
法律后果的严重性：
- 违法加建不仅可能导致经济损失，还可能面临刑事责任。在严重情况下，如加建行为导致重大安全事故或环境污染等，相关责任人可能面临刑事追究。
三、合法化建议
为确保租集体的厂房自己投资加建的合法性，建议遵循以下建议：
充分了解法律法规：
- 在加建前深入了解相关法律法规和审批程序，确保自身行为符合法律规定。可以咨询当地自然资源主管部门或聘请专业律师进行法律指导。
严格办理审批手续：
- 按照法定程序逐一办理相关审批手续，确保建设活动的合法性。不要抱有侥幸心理，以免因违法加建而面临法律风险。
保持沟通与合作：
- 与村集体和相关部门保持良好的沟通与合作，及时了解政策动态和审批要求。在加建过程中，积极配合相关部门的检查和监督，确保建设行为符合规定。
规范合同签订：
- 签订合法有效的补充协议，明确双方权利义务，避免纠纷发生。在签订补充协议时，应仔细阅读合同条款，确保自身权益得到充分保障。
总结来说，租集体的厂房自己投资加建的合法性取决于是否满足一系列法定条件和程序。为确保加建行为的合法性并避免可能的法律风险，建议在加建前充分了解相关法律法规和审批程序，并严格办理相关审批手续。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。