在交通事故中，若对方负主要责任，停运费的计算和承担需结合实际情况，分以下情况处理：

1. 停运费的性质与法律依据
   停运费属于因交通事故导致的间接财产损失，根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条，因车辆停运造成的损失，侵权人应予以赔偿。但需注意：停运费需以“实际减少的收入”为限，需提供证据证明停运期间的收入损失（如运营合同、收入流水、维修时间证明等）。

2. 责任比例对停运费的影响
   若对方负主责（通常为70%-90%责任），停运费的赔偿金额需按责任比例分担。例如：

   • 停运总损失为10,000元，对方主责（按70%计算），则对方需赔偿7,000元；
     
   • 剩余30%由己方或己方保险公司承担（若己方有责任）。
     关键点：责任比例需以交警出具的《交通事故责任认定书》为准，若对责任划分有异议，需在3日内申请复核。

3. 停运费的计算方式
   停运费通常按“日均收入×停运天数”计算，需提供以下证据：

   • 收入证明：如近3个月的运营收入流水、纳税记录、行业平均收入标准等；
     
   • 停运时间证明：如维修厂出具的维修时间证明、交警扣车时间证明等；
     
   • 运营合同：若为租赁车辆或挂靠运营，需提供合同证明收入来源。
     示例：若日均收入为500元，停运20天，则总损失为10,000元，对方按主责比例赔偿。

4. 保险公司的角色

   • 若对方投保了交强险和商业三者险，停运费通常由商业三者险赔偿，但需注意：
     
     • 部分保险公司可能以“间接损失”为由拒赔，此时需通过诉讼主张权利；
       
     • 若对方未投保或保额不足，需由对方个人承担剩余部分。
       
   • 建议：在事故后及时联系对方保险公司定损，并保留沟通记录。

5. 实务中的注意事项

   • 证据保留：务必保存维修发票、收入证明、责任认定书等关键材料；
     
   • 协商与诉讼：优先与对方协商赔偿，若协商不成，可在1年内向法院起诉（诉讼时效为3年，但建议尽快处理）；
     
   • 地区差异：部分地区对停运费有地方性规定（如出租车行业指导价），需结合当地政策主张赔偿。

总结：对方主责时，停运费需按责任比例分担，计算以实际收入损失为准，并需提供充分证据。若遇保险公司拒赔或对方不配合，建议通过法律途径解决。如有具体证据或案件细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。