周末没有及时回复公司消息，公司以此为由进行罚款通常是不正常的，且可能涉嫌违法。以下从不同角度为你详细分析：
从劳动法律法规角度
根据我国《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，用人单位不得随意对劳动者进行罚款。罚款属于一种行政处罚措施，而企业并非行政机关，不具有行政处罚权。除非劳动者因故意或重大过失给用人单位造成经济损失，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但这也并非罚款，且赔偿金额有严格限制（一般不超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准）。周末未及时回复消息，很难认定为给公司造成经济损失的故意或重大过失行为，因此公司以此罚款缺乏法律依据。
从公司规章制度角度
即使公司内部规章制度中规定了“周末未及时回复消息将进行罚款”，该规定也可能因违反法律法规而无效。根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。并且，规章制度应当公示或者告知劳动者。如果公司未履行上述法定程序，或者规章制度内容本身违法，那么该规章制度对劳动者不具有约束力，公司依据此规章制度进行罚款也是不合法的。
从实际操作角度
如果公司确实存在周末要求员工及时回复消息的情况，建议员工首先与公司进行沟通协商，明确工作要求和休息时间的界限。如果公司坚持罚款，员工可以收集相关证据（如公司罚款通知、规章制度文本、沟通记录等），向当地劳动监察部门投诉，或者依法申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
总结与建议：公司以周末未及时回复消息为由对员工进行罚款，通常是不合法且不合理的。员工在面对这种情况时，应了解自己的合法权益，积极与公司沟通协商，必要时通过法律途径维护自己的权益。如果你还有其他相关问题，欢迎继续向我咨询。