结论：公司上班但由另一家公司发工资，这种情况是否会产生影响，取决于两家公司之间的关系以及具体的操作方式。以下从不同角度进行分析：

1. 关联公司或集团内部调配：

   • 情况说明：若两家公司属于同一集团或存在关联关系，且这种工资发放方式是集团内部调配或管理的一部分，通常这种安排是合法的，且不会对员工产生不利影响。集团内部可能出于税务优化、资金管理或人力资源调配等考虑，采取这种工资发放方式。
   • 法律建议：员工应确认两家公司之间的关联关系，并了解这种工资发放方式的具体原因和目的。同时，员工应确保自己的劳动合同、社保缴纳等权益不受影响。

2. 非关联公司代发工资：

   • 情况说明：若两家公司无关联关系，但其中一家公司（非员工实际工作单位）代发工资，这种情况可能涉及税务、劳动法等多方面的问题。例如，代发工资的公司可能需要承担一定的税务责任，而员工也可能面临社保缴纳、劳动合同签订等方面的风险。
   • 法律风险：
     • 税务风险：代发工资的公司可能需要按照税法规定代扣代缴个人所得税，若未履行该义务，可能面临税务处罚。
     • 劳动法风险：员工应与实际工作单位签订劳动合同，并由该单位缴纳社保。若工资由非工作单位代发，可能导致劳动合同和社保缴纳关系混乱，进而影响员工的权益。
   • 法律建议：员工应谨慎对待非关联公司代发工资的情况，确保自己的劳动合同、社保缴纳等权益得到保障。若存在疑问或风险，应及时向专业律师咨询。

3. 潜在的法律后果：

   • 若操作不当：如未按照税法规定代扣代缴个人所得税，或未确保员工的劳动合同和社保缴纳关系清晰，可能面临税务处罚、劳动争议等法律后果。
   • 对员工的影响：工资发放方式的混乱可能导致员工在维权时面临困难，如难以证明劳动关系、社保缴纳情况等。

综合建议：

• 员工应首先确认两家公司之间的关系以及工资发放方式的具体原因和目的。
• 确保自己的劳动合同、社保缴纳等权益不受影响，必要时可要求实际工作单位出具相关证明。
• 若对工资发放方式存在疑问或风险，应及时向专业律师咨询，以维护自己的合法权益。

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