针对您提出的问题，首先明确结论：若直属领导已书面同意您离职，但公司不认账并称您旷工，您可以通过收集证据、与公司协商、申请劳动仲裁等途径来维护自己的合法权益。
一、证据收集与固定
书面离职申请及领导同意记录：首先，您需要找到并保存好您向直属领导提交的书面离职申请，以及领导同意您离职的书面记录（如邮件、微信聊天记录、纸质签字文件等）。这些证据是证明您已按照公司规定提出离职，并得到领导同意的关键。
工作交接记录：如果您已经进行了工作交接，请保存好相关的交接记录或确认文件。这可以证明您已经履行了离职前的义务，并非无故旷工。
考勤记录：收集您的考勤记录，特别是离职前后的考勤情况，以证明您并非无故缺勤。
二、与公司协商
在收集好证据后，您可以尝试与公司进行协商，解释情况并出示相关证据。如果公司仍然坚持称您旷工，并可能因此对您进行处罚或解除劳动合同，您可以明确告知公司，您将通过法律途径维护自己的权益。
三、申请劳动仲裁
如果协商无果，您可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请劳动仲裁时，您需要提交以下材料：
劳动仲裁申请书：详细陈述您的仲裁请求、事实和理由。
相关证据材料：包括上述提到的书面离职申请、领导同意记录、工作交接记录、考勤记录等。
身份证明：如身份证复印件等。
劳动仲裁的流程通常包括：
四、可能的法律后果
如果劳动仲裁委员会认定您并非旷工：公司可能需要支付您离职前的工资、经济补偿金（如果符合法定条件）等，并可能因违法解除劳动合同而面临赔偿。
如果劳动仲裁委员会认定您旷工：您可能需要承担旷工期间的工资损失等责任，但这种情况需要公司有充分的证据证明您确实旷工，且您无法提供相反证据。
五、建议与提醒
保持冷静与理性：在处理此类纠纷时，请保持冷静与理性，避免情绪化行为影响您的判断和决策。
及时咨询专业律师：虽然我已经为您提供了一些基本的法律建议，但劳动纠纷往往涉及复杂的法律问题和证据收集，因此建议您在必要时及时咨询专业律师，以便更全面地了解自己的权益和可能的法律后果。
注意时效问题：劳动仲裁和诉讼都有时效限制，请务必在法定时效内提出申请或起诉，以免丧失维权机会。
希望以上建议能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。