关于公路上停车收费是否合法的问题，这需要根据具体情况和相关法律法规来综合判断。

首先，我们要明确的是，如果停车收费是经过政府相关部门批准，并依据相关法律法规进行的，那么这种收费是合法的。例如，在县城或城市中，为了有效缓解停车难问题，提高停车泊位的周转率，政府可能会根据《城市道路占用挖掘收费管理办法》和《城市道路管理条例》等相关规定，对占用道路停车的行为收取一定的费用。这种收费属于行政性收费，目的是为了合理利用公共资源，满足短时间临时停车的需求。

然而，如果停车收费是未经政府批准，擅自设立的，那么这种收费就是非法的。根据《中华人民共和国公路法》和《收费公路管理条例》的相关规定，擅自在公路上设卡、收费的，将由交通主管部门责令停止违法行为，没收违法所得，并可能面临罚款等行政处罚。

对于您关心的费用用途去向问题，如果是合法的停车收费，政府相关部门通常会公开费用的使用情况，确保费用的透明度和合理性。同时，收费单位在收取费用后，也应当承担一定的管理责任。如果车辆在收费位置停放受损，虽然路面停车收取的是占用公共资源的费用，并不直接构成车辆保管合同法律关系，但收费单位仍应积极协助车主处理相关事宜，如提供监控录像等证据，帮助车主追责。

最后，如果您发现身边有擅自在公路上设卡、收费的行为，可以向当地交通主管部门进行举报，相关部门将会依法进行处理，维护公路交通的秩序和公共利益。

综上所述，公路上停车收费是否合法，关键在于是否经过政府批准并依据相关法律法规进行。如果您对此有疑问或发现非法收费行为，建议及时向相关部门咨询或举报。