结论前置：公司通过第三方发工资，并不影响你申请劳动仲裁的效力，仲裁是有用的。下面我从几个方面详细解释：

1. 劳动关系认定：

   • 劳动关系的认定并不完全取决于工资的发放方式。即使公司通过第三方发放工资，只要你能提供证据证明你与公司之间存在事实上的劳动关系（如工作证、考勤记录、工作邮件、同事证言等），劳动仲裁委员会就会认可你们之间的劳动关系。

2. 工资发放记录的获取：

   • 虽然工资是通过第三方发放的，但你仍然有权要求公司提供工资发放记录或银行流水等证明你工资收入的文件。如果公司拒绝提供，你可以在劳动仲裁过程中申请仲裁委员会责令公司提供，或者通过其他途径（如向银行申请查询交易记录）获取相关证据。

3. 劳动仲裁的申请与受理：

   • 只要你认为公司存在违反劳动法律法规的行为（如未按时支付工资、未缴纳社会保险等），你都可以向劳动仲裁委员会申请仲裁。劳动仲裁委员会在受理案件时，会审查你提供的证据和申请事项，如果符合受理条件，就会依法受理并展开调查。

4. 仲裁过程中的举证责任：

   • 在劳动仲裁过程中，你需要承担一定的举证责任，证明公司存在违法行为。这包括提供证据证明你与公司之间的劳动关系、公司的违法行为以及你因此遭受的损失等。虽然工资发放记录是重要证据之一，但并非唯一证据。你可以结合其他证据来支持你的主张。

5. 可能的法律后果：

   • 如果劳动仲裁委员会认定公司存在违法行为，它会依法作出裁决，要求公司承担相应的法律责任（如支付拖欠的工资、经济补偿金等）。如果公司不履行裁决，你还可以向人民法院申请强制执行。

建议：

• 在申请劳动仲裁前，尽量收集并保存好与劳动关系和工资发放相关的证据，以便在仲裁过程中有力地支持你的主张。
• 如果对劳动仲裁流程或相关法律法规不熟悉，可以寻求专业律师的帮助，以确保你的权益得到充分保障。

如果你还有其他关于劳动工伤或劳动仲裁的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。