结论前置：迟到是否会扣一天工资，这主要取决于用人单位的规章制度以及劳动合同中的相关约定，但在大多数情况下，迟到扣一天工资的做法是不合理且可能违法的。
一、法律层面分析
《中华人民共和国劳动法》第五十条：
- 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这里的“克扣”指的是无故扣减工资，而迟到扣一天工资明显属于无故过度扣减工资的情况。
《工资支付暂行规定（1994年版）》第十五条及第十六条：
- 第十五条指出，用人单位不得克扣劳动者工资，仅在特定情况下（如代扣代缴个人所得税、社会保险费用等）可以代扣。迟到并不属于这些可代扣工资的情形。
- 第十六条进一步明确，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可要求其赔偿，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。迟到扣一天工资显然远超这一比例限制。
二、合理性层面分析
惩罚与过错不匹配：
- 迟到一小时与旷工一天在性质上存在显著差异。迟到属于轻微违纪，而旷工则构成严重违反劳动纪律。将两者等同处理，既不符合过罚相当原则，也损害了劳动者的合法权益。
管理手段单一化：
- 通过高额罚款替代教育引导，不仅难以解决迟到问题，还可能激化劳资矛盾。企业应优先通过优化考勤制度、改善工作环境等正向措施提升员工守时意识。
经济负担不合理：
- 对低收入劳动者而言，单日工资可能占月收入的重要比例。迟到扣一天工资将直接加重其生活压力，违背劳动法保护弱势群体的立法宗旨。
三、实际操作建议
对于用人单位：
- 应依法建立和完善规章制度，确保内容合法、合理且经过民主程序制定。在处理员工迟到等问题时，应遵循合法、合理、公平的原则，避免过度处罚。
- 建议设定合理的迟到扣罚措施，如迟到一次扣除一定金额（该金额应合理且不超过法律规定的上限），并确保该金额与迟到造成的影响相对合理匹配。
对于劳动者：
- 应了解自己的权益和义务，对用人单位的不合理规定有权提出异议并要求纠正。
- 如遇到权益受损的情况，应先与用人单位沟通协商；协商不成时，可向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁乃至提起诉讼来维护自己的合法权益。
四、实际案例参考
在实际案例中，法院已判决用人单位因迟到扣款过多而需向劳动者支付工资差额。这些案例表明，用人单位在行使管理权时，必须合理且善意，不能随意扩大劳动者的违纪后果或加重其违纪责任。
总结：迟到扣一天工资的做法在大多数情况下是不合理且可能违法的。用人单位和劳动者都应充分了解相关法律法规，确保在处理此类问题时能够依法行事，保护双方的合法权益。如果您在劳动工伤（工资福利）方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。