迟到早退是否会扣工资，关键在于用人单位的规章制度、劳动合同约定以及相关法律法规的遵循情况。以下是对此问题的详细分析：

1. 合法性前提：

   • 用人单位因迟到早退扣工资，必须遵循合法、合理、透明及公正的原则。扣款行为需有明确的法律依据或劳动合同约定，且扣款标准应事先明确并告知劳动者。
   • 根据《工资支付暂行规定》，用人单位不得随意克扣工资，除非符合法律规定的特定情形（如代扣税费、社保等），或因劳动者原因给用人单位造成经济损失，且扣款不得超过法定限额。

2. 扣款方式与标准：

   • 固定金额扣款：每次迟到或早退扣除一个固定的金额，如公司规定每次迟到15分钟以内，扣除30元。
   • 按时间比例扣款：根据迟到或早退的时长占正常工作时间的比例来计算扣款金额，如员工日薪200元，迟到1小时则扣除约25元工资。
   • 累计次数扣款：设定一个迟到早退的次数阈值，达到该阈值后进行相应金额的扣款，如一个月内迟到早退累计达到3次，从第4次开始每次扣除100元。
   • 全勤奖励扣除：不直接对迟到早退行为进行罚款，而是设立全勤奖，如有迟到早退情况则取消全勤奖。

3. 扣款合法性与限额：

   • 合法性要求：扣款行为需有劳动合同约定或法律依据，否则构成违法克扣工资。劳动者对扣款制度有异议时，有权要求解释或向相关部门投诉。
   • 扣款限额：因劳动者原因给用人单位造成经济损失的，扣款不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

4. 特殊情况处理：

   • 对于因不可抗力等特殊原因（如交通拥堵、突发疾病等）导致的迟到早退，用人单位应酌情处理，避免简单按照常规规定扣款。

5. 劳动者权益保护与救济途径：

   • 权益保护：劳动者应了解自己的权利和义务，对不合理的扣款行为有权提出质疑并要求解释。用人单位应尊重劳动者权益，确保扣款行为的合法性和合理性。
   • 救济途径：如认为用人单位扣款行为违法或不合理，劳动者可先与用人单位沟通协商；协商不成时，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自己的合法权益。

示例说明：

• 假设某员工日薪为200元，公司规定迟到1小时扣除当天工资的1/8（即25元），且每月迟到累计超过3次后，从第4次开始每次额外扣除50元。若该员工本月迟到4次，其中前3次每次迟到1小时，第4次迟到2小时，则其本月因迟到被扣除的工资为：前3次每次25元，共75元；第4次因超过3次且迟到2小时，扣除当天工资的1/4（即50元）加上额外50元，共100元。因此，该员工本月因迟到被扣除的总工资为175元。

总结与建议：

• 用人单位在制定和执行迟到早退扣款制度时，应确保制度的合法性、合理性和透明度，避免侵犯劳动者权益。
• 劳动者应了解自己的权利和义务，对不合理的扣款行为及时提出质疑并寻求救济途径。
• 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。