在劳动争议案件中，若双方（劳动者与用人单位）均提起诉讼，法院会按照以下原则和程序处理，核心结论是法院会合并审理并依法裁判，但需注意诉讼地位、诉讼请求的合并与抗辩等问题，具体分析如下：

1. 诉讼地位的确定：互为原被告或反诉关系

• 双方互为原被告：若劳动者先起诉（如主张工资、经济补偿等），用人单位随后也起诉（如主张赔偿损失、违约金等），法院会将两案合并审理，双方互为原被告。此时，法院会在一份判决中同时处理双方的诉求。
• 反诉的认定：若用人单位的起诉与劳动者的本诉存在直接关联（如劳动者主张违法解除赔偿，用人单位主张劳动者严重违纪造成损失），法院可能将其视为反诉，与本诉合并审理。反诉需在本诉庭审辩论终结前提出，且需属于同一法律关系。

2. 诉讼请求的合并处理：避免重复裁判

• 抵销或冲抵：若双方的诉讼请求存在关联（如劳动者主张工资，用人单位主张劳动者借款未还），法院可能直接在劳动争议中抵销或冲抵，无需另行起诉。
• 独立审理：若诉讼请求无直接关联（如劳动者主张加班费，用人单位主张商业秘密侵权），法院会分别审理，但可能合并开庭以提高效率。

3. 举证责任与抗辩的交叉

• 双方均需举证：劳动者需证明其主张（如存在劳动关系、加班事实等），用人单位需证明其抗辩（如已足额支付工资、解除合法等）。若用人单位提起反诉，需承担反诉部分的举证责任。
• 抗辩的相互影响：例如，劳动者主张违法解除赔偿，用人单位抗辩解除合法并反诉劳动者违约，法院会同时审查解除合法性及违约事实，避免矛盾裁判。

4. 裁判结果的统一性

• 一份判决解决所有争议：法院会在一份判决中明确支持或驳回双方的诉讼请求，避免出现相互矛盾的裁判。例如，若法院认定解除合法，则驳回劳动者赔偿请求，同时可能支持用人单位反诉的违约金（如合同有约定且合法）。
• 二审与再审的合并：若一方不服判决上诉，二审法院会全面审查双方诉求；再审程序亦同理，确保争议彻底解决。

5. 实务建议

• 劳动者：起诉时需明确诉求及依据，避免遗漏；若用人单位反诉，需针对性抗辩并准备反证（如解除合法性、赔偿合理性等）。
• 用人单位：反诉需在法定期限内提出，且与本诉关联；举证时需区分本诉与反诉的证据，避免混淆。
• 共同注意：双方均可申请法院调查取证、委托鉴定等，但需在举证期限内提出；庭审中需围绕对方诉求展开辩论，避免偏离焦点。

总结：劳动争议中双方起诉的，法院会合并审理并统一裁判，关键在于明确诉讼地位、合理主张诉求、充分举证抗辩。若您遇到此类问题，可直接向我咨询具体案件细节，我会结合证据和法律为您分析策略。