民间借贷中可以分别起诉被告和其配偶且不构成重复起诉，主要基于以下几个方面的法律考量：
诉讼主体的独立性：
- 在民间借贷纠纷中，被告作为借款人，是直接的债务承担者。而被告的配偶，虽然可能在婚姻关系存续期间与借款人共同生活，但并不意味着其自动成为债务的共同承担者，除非有证据证明该债务用于夫妻共同生活、共同生产经营或者基于夫妻双方共同意思表示。
- 因此，从诉讼主体的角度来看，被告和其配偶是两个独立的法律主体。原告有权选择仅起诉借款人（被告），也有权在符合法定条件的情况下，将借款人和其配偶作为共同被告一并起诉，或者先起诉借款人，再基于新发现的证据或法律事实起诉其配偶。
不构成重复起诉的法律要件：
- 重复起诉通常指的是同一原告对同一被告，就同一法律关系和同一事实再次提起诉讼。在民间借贷中，如果原告先起诉借款人并获得生效判决后，又发现该债务属于夫妻共同债务，此时再起诉借款人的配偶，并不构成重复起诉。
- 这是因为，虽然两次诉讼的标的（即债务）在实质上可能相同，但诉讼的对象（被告和其配偶）和诉讼的法律依据（如夫妻共同债务的认定）是不同的。此外，如果原告在第一次起诉时并未掌握足够证据证明债务属于夫妻共同债务，而在后续过程中获得了新证据，那么再次起诉也是合理的。
夫妻共同债务的认定标准：
- 根据相关法律规定，夫妻共同债务的认定需要满足一定条件，如债务用于夫妻共同生活、共同生产经营或者基于夫妻双方共同意思表示。如果原告能够提供充分证据证明这些条件成立，那么即使先起诉了借款人，也有权再起诉其配偶要求承担共同还款责任。
- 这种情况下，两次诉讼虽然都涉及同一笔债务，但诉讼的焦点和法律依据是不同的。第一次诉讼主要关注借款人与原告之间的债权债务关系，而第二次诉讼则主要关注该债务是否属于夫妻共同债务。
实际操作中的建议：
- 对于原告而言，在起诉前应尽可能收集充分证据，以证明债务的性质和用途。如果怀疑债务可能属于夫妻共同债务，可以考虑将借款人和其配偶一并列为被告，以减少诉讼成本和风险。
- 如果已经先起诉了借款人并获得了生效判决，但后续发现该债务属于夫妻共同债务，那么应及时收集新证据并再次起诉其配偶。在此过程中，应注意保持诉讼的时效性和证据的充分性。
总结来说，民间借贷中可以分别起诉被告和其配偶且不构成重复起诉，是因为诉讼主体具有独立性、不构成重复起诉的法律要件得到满足、夫妻共同债务的认定标准明确以及实际操作中的合理性。如果你在民间借贷中遇到了类似问题或有其他法律疑问，可以直接向我咨询。