违章建筑被拆除后，能否起诉主张赔偿需根据具体情况而定。以下是从不同角度进行的详细分析：
一般情况下不能主张赔偿：
- 违章建筑指的是未取得建设工程规划许可证或未按许可证规定建设的建筑物、构筑物。根据《中华人民共和国城乡规划法》和《中华人民共和国行政强制法》，行政机关对于违章建筑有权责令停止建设、限期改正，并依法进行拆除。
- 由于违章建筑本身不具有合法性，建造人对违章建筑不享有合法权益。因此，在行政机关按照法定程序拆除违章建筑的情况下，建造人通常无法获得赔偿。例如，若行政机关依法立案、调查取证、告知陈述申辩权利、作出责令限期拆除决定、催告、强制执行决定等，并最终拆除了违章建筑，建造人则无权主张赔偿。
特殊情况下可以主张赔偿：
- 行政机关程序违法：如果行政机关在拆除违章建筑时未履行法定程序，如未给予当事人陈述和申辩的机会，或未履行催告程序就直接拆除，导致当事人合法财产（如可搬离的财物）受损，当事人可以就因程序违法造成的合理损失起诉主张赔偿。
- 合法部分受损：即使建筑物整体被认定为违章，但其中可能包含合法的附属设施或投入，如装修材料、可移动设备等。若行政机关在拆除过程中未采取合理保护措施，导致这些合法财产受损，当事人有权就这部分损失提起诉讼要求赔偿。
- 行政机关存在过错：如果行政机关的行为（如未及时处理建房申请或给予错误指导）误导当事人进行了违章建设，而后又拆除该建筑，给当事人造成损失的，当事人可以主张行政机关承担相应的赔偿责任。
法律建议：
- 在面临违章建筑被拆除的情况时，建议当事人首先保留好相关证据，如拆除前后的照片、视频、物品清单等，以便在必要时为维权提供有力支持。
- 若确定拆除行为存在违法或导致合法财产受损，当事人应及时向法院提起诉讼，要求确认拆除行为违法，并主张相应的行政赔偿。法院将审查拆除行为的合法性以及是否存在过度损害等情况，进而作出判决。
可能法律后果：
- 如果当事人能够证明拆除行为存在违法或导致合法财产受损，且法院最终判决支持其赔偿请求，那么当事人将有权获得相应的赔偿。
- 如果当事人无法提供充分证据证明其主张，或者法院认为拆除行为合法且未造成合法财产受损，那么当事人的赔偿请求可能会被驳回。
综上所述，违章建筑被拆除后能否起诉主张赔偿需根据具体情况判断。在大多数情况下，由于违章建筑本身不具有合法性，建造人无法获得赔偿；但在特定情况下，如行政机关程序违法、合法部分受损或行政机关存在过错时，当事人有权提起诉讼并要求赔偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。