企业绩效工资扣罚超过40%是否会有处罚，这主要取决于企业扣罚绩效工资的具体依据、程序以及是否违反了相关法律法规的规定。以下从几个方面进行详细分析：

1. 劳动合同与规章制度：

   • 企业扣罚绩效工资应当有明确的依据，这通常来源于劳动合同中的约定或企业依法制定的规章制度。如果劳动合同或规章制度中明确规定了绩效工资的扣罚比例和条件，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么企业按照这些规定扣罚绩效工资，一般是合法的。
   • 然而，如果劳动合同或规章制度中没有明确规定扣罚比例，或者规定的比例过高（如超过40%），且没有合理的解释或依据，那么这种扣罚可能被视为违法。因为绩效工资作为劳动者劳动报酬的一部分，其扣罚应当遵循公平、合理的原则，不能随意剥夺劳动者的合法权益。

2. 法律法规的强制性规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果企业扣罚绩效工资的行为违反了这些规定，如扣罚比例过高导致劳动者实际收入低于当地最低工资标准，那么这种行为就是违法的。
   • 此外，如果企业扣罚绩效工资的行为缺乏合理的依据或程序，如未事先告知劳动者、未听取劳动者的意见等，也可能构成违法。因为这些行为侵犯了劳动者的知情权、参与权等合法权益。

3. 可能的法律后果：

   • 如果企业扣罚绩效工资的行为被认定为违法，那么劳动者有权要求企业补发被扣罚的工资，并可能要求企业支付相应的经济补偿或赔偿金。
   • 同时，企业还可能面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。这些处罚不仅会对企业的经济利益造成损失，还会影响企业的声誉和形象。

4. 建议与措施：

   • 对于劳动者来说，如果发现企业扣罚绩效工资的行为存在违法或不合理之处，应当及时与企业进行沟通协商，要求企业说明扣罚的依据和理由。
   • 如果沟通协商无果，劳动者可以向当地的劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，劳动者应当提供相关的证据材料，如劳动合同、工资单、扣罚通知等，以证明自己的主张。

总结来说，企业绩效工资扣罚超过40%是否会有处罚，取决于扣罚的依据、程序以及是否违反了相关法律法规的规定。如果扣罚行为合法且合理，那么一般不会受到处罚；但如果扣罚行为违法或不合理，那么企业可能面临补发工资、支付经济补偿或赔偿金以及劳动行政部门的处罚等法律后果。因此，建议企业在扣罚绩效工资时务必遵循相关法律法规的规定，确保扣罚行为的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。