公司违规获利5万，需根据违规性质及法律规定承担相应责任，具体处理方式如下：

1. 行政责任层面
   若违规行为违反《公司法》《反不正当竞争法》《税收征收管理法》等行政法规（如虚假宣传、偷逃税款、违规经营等），监管部门可责令公司停止违法行为，没收违法所得5万元，并处以罚款。罚款金额通常为违法所得的1-5倍（具体比例依违规类型而定），例如偷逃税款可能面临补缴税款、滞纳金及0.5-5倍罚款。此外，公司可能被责令整改、限制业务活动或吊销营业执照（严重违规时）。

2. 刑事责任层面
   若违规行为构成犯罪（如诈骗、非法经营、侵犯知识产权等），需依法追究刑事责任。根据《刑法》相关规定，单位犯罪的，对公司判处罚金，同时对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处以刑罚。例如，非法经营罪中，违法所得5万元可能达到“情节严重”标准，对公司判处罚金，对责任人处五年以下有期徒刑或拘役；若涉及诈骗罪，5万元属于“数额巨大”，责任人可能面临三年以上十年以下有期徒刑。

3. 民事责任层面
   若违规行为损害他人合法权益（如消费者、合作伙伴），公司需承担民事赔偿责任。例如，因虚假宣传导致消费者损失的，公司需退还货款并赔偿损失；若违反合同约定获利，需向合同相对方返还违法所得并支付违约金。

建议行动步骤：

• 立即自查：梳理违规行为的具体事实、法律依据及证据（如合同、财务记录、沟通记录等），评估法律风险等级。
  
• 主动整改：停止违规行为，补缴税款、罚款或赔偿损失，向监管部门提交整改报告（若涉及行政处罚）。
  
• 咨询专业律师：根据违规类型制定应对策略，例如通过行政复议或诉讼争取减轻处罚，或与受害方协商和解以降低民事赔偿风险。
  

提示：法律责任的具体承担方式需结合违规行为的具体情节、主观恶意程度及社会危害性综合判断。若需进一步分析，可向我提供违规行为的详细信息（如行业、违规方式、是否已被调查等），我将为您定制解决方案。