结论：在高速上被追尾后，若4S店修车修了两个月，您可以通过多种途径来处理这个问题，包括与4S店协商、向保险公司申请理赔、寻求消费者协会帮助或通过法律途径解决。
详细分析：
与4S店协商：
- 首先，您可以与4S店进行沟通，了解修车时间过长的原因。如果是因为4S店自身的原因（如配件供应不足、维修技术问题等）导致修车时间延长，您可以要求4S店给出合理的解释，并协商一个合理的解决方案，如提供代步车、减免部分维修费用等。
向保险公司申请理赔：
- 如果您购买了车辆损失险，且事故责任在对方，那么您可以向自己的保险公司申请理赔。在理赔过程中，您可以向保险公司说明修车时间过长的情况，并请求保险公司协助与4S店沟通，以加快修车进度。同时，您也可以根据保险合同的约定，要求保险公司承担因修车时间过长而产生的合理费用（如交通费、住宿费等）。
寻求消费者协会帮助：
- 如果与4S店的协商无果，您可以向当地的消费者协会投诉。消费者协会会介入调查，并根据调查结果给出相应的处理意见。如果消费者协会认为4S店存在过错，可能会要求4S店给出赔偿或采取其他补救措施。
通过法律途径解决：
- 如果以上途径均无法解决问题，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。您可以向法院提起诉讼，要求4S店承担因修车时间过长而给您造成的损失。在诉讼过程中，您需要提供相关证据（如事故认定书、修车合同、修车发票等）来证明自己的主张。
额外建议：
- 在处理此类问题时，建议您保留好所有相关证据，包括事故认定书、修车合同、修车发票、与4S店的沟通记录等。这些证据将在后续协商、理赔或诉讼过程中发挥重要作用。
- 如果您对法律程序不熟悉或担心自己无法有效维护权益，可以考虑咨询专业律师（当然，您可以直接向我咨询，我专注于婚姻家庭、交通事故赔偿领域）。律师将能够为您提供专业的法律建议和帮助，确保您的权益得到充分保障。
可能涉及的法律条款：
- 根据《中华人民共和国消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买商品或接受服务时享有知情权、选择权、公平交易权等权益。如果4S店在修车过程中存在过错或未履行相关义务，您有权要求其承担相应的法律责任。
- 根据《中华人民共和国保险法》的相关规定，保险公司应当按照保险合同的约定履行赔偿义务。如果保险公司未按照约定履行赔偿义务或存在其他过错，您有权向保险公司提出投诉或要求其承担相应的法律责任。