如果餐饮店店长恶意对待员工，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 确保自身安全并收集证据：

   • 在遭遇店长的恶意行为时，员工应首先确保自身安全，避免与店长发生直接冲突。如果条件允许，可以使用手机等设备悄悄拍摄店长的恶意行为，包括时间、地点、涉及人员及具体行为，作为日后维权的关键证据。
   • 同时，寻找在场的同事、顾客等作为证人，并请求他们事后提供证言，以证明事件的经过和具体情况。
   • 若身体受到伤害，应立即就医，并妥善保留医院的诊断证明、病历、检查报告及医疗费票据等，作为受伤情况和损失的有力证据。

2. 内部反映与协商：

   • 在确保安全和保留证据后，员工应尝试通过餐饮店内部的正规渠道反映问题，如向其他管理层或人力资源部门报告店长的不当行为，并提出合理诉求，如要求店长赔礼道歉、支付医疗费、恢复正常工作安排等。
   • 通过内部调解机构或双方沟通，寻求问题的解决方案，以维护工作关系的相对稳定。

3. 依法采取外部行动：

   • 报警处理：如果店长的行为构成违法行为，如殴打、辱骂等，员工应及时向公安机关报案。警察会对案件进行调查处理，并依法给予店长相应的治安处罚。若伤情达到轻伤及以上程度，店长还可能涉嫌刑事犯罪，将被依法追究刑事责任。
   • 劳动部门投诉：员工可向当地劳动监察部门投诉店长的违法行为，要求餐饮店改正并给予相应处罚。
   • 劳动仲裁与诉讼：若与餐饮店就赔偿、劳动关系等问题产生争议，员工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向人民法院提起民事诉讼，要求店长或餐饮店承担民事赔偿责任。在仲裁或诉讼过程中，员工需详细陈述事件经过，并提交各项证据。
   • 工会组织帮助：员工还可向所在单位的工会组织或当地总工会反映情况，寻求咨询、支持和帮助。

4. 了解相关法律规定：

   • 根据《治安管理处罚法》，殴打他人或故意伤害他人身体的，将面临五日以上十日以下拘留，并处二百元以上五百元以下罚款；情节较轻的，处五日以下拘留或五百元以下罚款。
   • 若店长的行为构成故意伤害罪，根据《刑法》规定，将面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制；致人重伤的，处三年以上十年以下有期徒刑；致人死亡或以特别残忍手段致人重伤造成严重残疾的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑甚至死刑。
   • 员工因店长的恶意行为遭受人身伤害和精神损害的，有权通过民事诉讼要求店长或餐饮店承担民事赔偿责任，赔偿范围可能包括医疗费、误工费、护理费、营养费、精神损害抚慰金等。

在采取上述措施时，员工应注意以下几点：

• 保持冷静，避免与店长发生直接冲突，确保自身安全。
• 全面收集证据，包括现场记录、证人证言、伤情证据等，以支持自己的诉求。
• 依法维权，不要采取过激行为或非法手段来解决问题。
• 如有需要，及时寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。

如果员工在维护自己权益的过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议和指导。