结论：厂里以员工有13万的货没做好为由扣一半工资，这一做法是否合法不能一概而论，需要结合具体情况来判断。

分析如下：

1. 从劳动合同和规章制度的角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者应当按照劳动合同的约定，全面履行各自的义务。如果劳动合同或用人单位的规章制度中明确规定了员工因工作失误或未完成工作任务应承担的责任，以及相应的工资扣除标准，且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位在员工确实存在未完成工作任务的情况下，按照约定或规定扣除工资，可能是合法的。
   • 但在此案例中，若劳动合同或规章制度中并未明确规定此类情况下的工资扣除标准，或者规定的扣除比例过高（如直接扣除一半工资），则可能违反了法律法规的公平原则和合理性要求，此时用人单位的做法可能不合法。

2. 从实际损失和因果关系的角度：

   • 即使劳动合同或规章制度中有相关规定，用人单位也需要证明员工未完成的工作任务与厂里遭受的损失之间存在直接的因果关系，且损失金额确实为13万。如果用人单位无法提供充分的证据证明这一点，那么其扣除工资的做法可能缺乏事实依据，从而不合法。
   • 另外，即使存在因果关系，用人单位扣除的工资数额也不应超过员工当月工资的20%（根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%）。若扣除比例超过此限制，则可能违法。

3. 从程序正当性的角度：

   • 用人单位在扣除员工工资前，应当与员工进行充分的沟通，说明扣除的原因、依据和数额，并听取员工的意见。如果用人单位未经沟通或未给予员工合理的解释和申诉机会，直接扣除工资，可能违反了程序正当性的要求，从而不合法。

建议：

• 对于员工而言，如果认为用人单位扣除工资的做法不合法，可以先与用人单位进行协商，要求其提供扣除工资的合法依据和计算方式。如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
• 对于用人单位而言，应当完善劳动合同和规章制度，明确员工因工作失误或未完成工作任务应承担的责任和工资扣除标准。同时，在扣除员工工资前，应当确保有充分的证据证明损失的存在和因果关系，并遵循程序正当性的要求，与员工进行充分的沟通和协商。

可能后果：

• 如果用人单位扣除工资的做法被认定为不合法，可能需要向员工支付被扣除的工资及相应的经济补偿金，并可能面临劳动监察部门的处罚。
• 如果员工因此提起劳动仲裁或诉讼，用人单位还可能需要承担仲裁费用或诉讼费用等额外成本。

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