药店离职要求赔偿三个月效期药是否合法，需根据具体情况判断，以下从不同角度为你详细分析：
一、通常不合法的情形
- 药品管理责任主体为药店
- 根据《药品管理法》等相关法律法规，药店作为药品经营企业，是药品质量和管理的责任主体。药店有义务建立完善的药品质量管理体系，涵盖采购、验收、储存、养护和销售等环节，以此确保药品在有效期内符合质量要求。
- 效期药的出现往往与药店整体管理不善有关，比如采购计划不合理，导致药品积压临近效期；库存管理不当，使得药品未能及时销售；养护措施不到位，影响药品质量等。所以，不能简单地将责任归咎于员工，药店要求员工赔偿效期药通常是不合理的。
- 举例：药店采购人员没有根据市场需求和销售情况合理采购药品，导致大量药品临近效期仍未售出，这种情况下要求员工赔偿就不合法。
- 员工履行职务行为
- 员工在药店工作，按照药店的管理制度和工作要求进行操作，其行为属于职务行为。在正常履行工作职责的情况下，即便出现效期药，也不应由员工承担赔偿责任。
- 举例：员工按照规定进行药品盘点和养护，但因药店采购计划不合理导致药品积压临近效期，此时要求员工赔偿是不合理的。
二、可能合法的特殊情况
- 员工存在重大过错
- 如果员工存在故意或重大过失行为，例如违反药品储存条件规定，未按要求将需要冷藏的药品放入冰箱，导致药品提前失效；或者故意隐瞒药品临近效期的情况，造成药品过期，那么药店要求员工赔偿具有一定合理性。
- 不过，在此情况下，药店也需确保赔偿要求符合相关法律法规，并遵循公平合理的原则。比如赔偿金额不能过高，要综合考虑员工的过错程度、实际损失等因素。
- 有合法有效的规章制度
- 药店制定了合法有效的规章制度，明确规定了在特定情况下员工需要对效期药承担赔偿责任。该规章制度需经过民主程序制定，如经过职工代表大会或全体职工讨论等，并已向员工公示。
- 在此前提下，如果员工违反规定导致效期药产生，药店可以按照规章制度要求员工赔偿，但赔偿金额应合理且符合法律法规规定。
- 举例：药店规章制度规定，员工未按规定对药品进行定期检查，导致效期药未及时处理，造成药店损失的，员工需承担一定比例的赔偿责任，且该制度经过民主程序制定并公示，员工也签字确认知晓，这种情况下药店要求赔偿可能合法。
三、员工权益保障
- 如果药店要求员工赔偿效期药，员工认为不合理，可以先与药店进行协商沟通，说明情况，提供相关证据证明自己不应承担赔偿责任。
- 若协商不成，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，员工需要准备相关证据，如劳动合同、药店规章制度、工作记录、与药店沟通的记录等，以证明自己的主张。
如果你遇到了药店离职要求赔偿效期药的情况，且不确定是否合法，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你详细分析并提供专业的法律建议。