食品生产企业外设仓库的管辖问题，主要依据仓库所在地的具体位置及企业登记注册情况，由相应的市场监督管理部门进行管辖。具体分析如下：
仓库与企业在同一县级辖区内：
- 若食品生产企业的外设仓库位于其登记注册的同一县级辖区内，那么该仓库的监管工作通常由企业所在地的县级市场监督管理部门负责。这是因为仓库作为企业生产经营活动的一部分，其监管应纳入企业整体监管范畴。
仓库与企业不在同一县级辖区内：
- 若仓库位于其他县级辖区内，根据相关法律法规及实践，仓库所在地的县级市场监督管理部门将负责对该仓库进行监管。这是为了确保监管的及时性和有效性，防止因地域差异导致的监管空白。
特殊情况下的管辖：
- 在某些特殊情况下，如仓库规模较大、涉及多个地区或存在复杂的监管需求时，可能会由更高层级的市场监督管理部门（如市级或省级）进行协调监管，或者指定特定的监管机构负责。
- 此外，如果仓库涉及进口食品或出口食品的存储，还可能受到海关等部门的额外监管。
建议：
- 食品生产企业在设立外设仓库时，应充分了解并遵守相关法律法规及监管要求，确保仓库的合法合规运营。
- 企业应与仓库所在地的市场监督管理部门保持密切联系，及时了解监管动态和要求，配合监管工作。
- 如遇监管问题或争议，企业可积极与监管部门沟通协商，寻求合理解决方案；必要时，可寻求专业法律支持以维护自身合法权益。
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