若被公告涉嫌严重违法犯罪但最终因证据不足未被定罪，可采取以下措施维护自身权益：

1. 要求撤销公告并消除影响
   根据《刑事诉讼法》第十二条及《民法典》第一千零二十四条，未经法院依法判决，任何人不得被认定为有罪。若公告内容已对个人名誉、社会评价造成损害，可向发布公告的机关（如公安机关、监察机关）提出书面异议，要求立即撤销公告并公开澄清事实。若对方拒绝，可依法提起名誉权侵权诉讼，主张停止侵害、恢复名誉、赔礼道歉及赔偿损失。

2. 申请国家赔偿（若存在错误限制人身自由情形）
   若因证据不足被采取刑事强制措施（如拘留、逮捕）后无罪释放，可根据《国家赔偿法》第十七条申请国家赔偿。需满足以下条件：

   • 已被羁押且期限届满；
     
   • 最终无罪（包括检察院不起诉、法院判决无罪等情形）；
     
   • 赔偿请求需在释放后两年内提出。
     赔偿范围包括人身自由赔偿金、精神损害抚慰金等。

3. 追究办案机关违法责任（若存在程序违法）
   若办案机关在调查过程中存在超期羁押、刑讯逼供、违法取证等程序违法行为，可向同级或上级检察机关提出控告，要求立案监督或追究相关人员责任。根据《刑事诉讼法》第一百一十七条，对违法侦查行为，当事人有权向检察机关申诉或控告。

4. 刑事申诉与复议（针对特定程序环节）

   • 若案件已进入审查起诉阶段但检察院作出不起诉决定，可依据《刑事诉讼法》第一百八十条向上一级检察院申诉；
     
   • 若公安机关撤销案件但认为处理不当，可依据《公安机关办理刑事案件程序规定》第一百八十六条申请复议。

实务建议：

• 立即固定证据：保存公告原文、传播记录、媒体报道等，作为后续维权依据；
  
• 委托律师介入：由律师协助分析案件程序合法性，制定申诉或诉讼策略；
  
• 谨慎对外发声：避免自行公开评论案件，防止被认定为“干扰司法程序”。
  

法律依据：

• 《刑事诉讼法》第十二条、第一百一十七条、第一百八十条；
  
• 《国家赔偿法》第十七条；
  
• 《民法典》第一千零二十四条；
  
• 《公安机关办理刑事案件程序规定》第一百八十六条。
  

如有进一步细节需分析（如公告发布主体、具体程序阶段等），可直接向我补充说明。