当公安机关办理刑事案件时，如果发现证据不足，会按照一系列既定的程序来处理。以下是对这一问题的详细解答：
一、补充侦查
- 要求：当公安机关在侦查过程中发现证据不够充分时，会要求对证据进行补充，以进一步查清案件事实。
- 次数与时间限制：
- 补充侦查有明确的次数和时间限制，最多可以补充侦查两次。
- 每次补充侦查的时间不能超过一个月。
二、决定立案与否
- 撤销案件：经过补充侦查后，如果证据仍然不足，达不到立案标准，公安机关会撤销这个案件。
- 移送审查起诉：若公安机关认为犯罪事实清晰，证据真实且足够充分，即使之前存在证据不足的情况，也会把案件移交给人民检察院进行审查起诉。
三、检察院的审查与处理
- 退回补充侦查或自行侦查：检察院在审查过程中，如果觉得证据不够，既可以把案件退回公安机关进行补充侦查，也可以自己展开侦查工作。
- 不起诉决定：
- 对于经过两次补充侦查的案件，如果人民检察院仍然觉得证据不足，不符合起诉条件，就会作出不起诉的决定。
- 若被害人对此不服，有两种解决途径：一是向上一级人民检察院申诉；二是不经过申诉环节，直接向人民法院提起诉讼。
四、审判阶段的处理
在审判阶段，如果法院认为证据不足，无法认定被告人有罪，会作出无罪判决。这体现了“疑罪从无”的原则，即当证据不足以支持指控时，应作出有利于被告人的处理。
五、嫌疑人的释放
- 侦查阶段：若公安机关经过侦查发现证据不足，不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件，并释放嫌疑人。
- 审查起诉阶段：检察院认为证据不足，不符合起诉条件的，在作出不起诉决定后，嫌疑人应被立即释放。
- 审判阶段：法院经过审理，认为证据不足，不能认定被告人有罪的，会作出无罪判决，并释放嫌疑人。
综上所述，公安机关在办理刑事案件时，如果遇到证据不足的情况，会按照法定程序进行补充侦查、决定是否立案、移送审查起诉等。在整个过程中，都严格遵循法律规定，确保案件处理的公正性和合法性。