被告单方委托的鉴定，在原告提出异议后，并不必然失去作为认定案件事实根据的效力，但能否被采纳需视具体情况而定。以下从多个角度进行分析：

1. 鉴定意见的采纳原则：

   • 在诉讼中，鉴定意见作为证据的一种，其采纳需遵循证据的合法性、真实性和关联性原则。被告单方委托的鉴定，只要符合这些原则，理论上是可以被采纳的。
   • 然而，由于鉴定意见的专业性和技术性较强，其准确性和公正性往往受到双方当事人的高度关注。因此，当原告对被告单方委托的鉴定提出异议时，法院会更为谨慎地审查该鉴定意见的合法性和可靠性。

2. 原告提出异议的影响：

   • 原告提出异议后，法院通常会要求被告提供鉴定机构的资质证明、鉴定人员的资格证明以及鉴定过程的相关记录等材料，以验证鉴定的合法性和公正性。
   • 如果原告能够提供充分的证据或理由表明该鉴定意见存在瑕疵或不可靠，法院可能会决定不采纳该鉴定意见，并可能要求重新鉴定或委托其他鉴定机构进行鉴定。

3. 法院的审查与判断：

   • 法院在审查鉴定意见时，会综合考虑鉴定机构的资质、鉴定人员的资格、鉴定过程的合法性、鉴定意见的合理性以及双方当事人的质证意见等因素。
   • 如果法院认为被告单方委托的鉴定意见存在重大瑕疵或不可靠，且原告提出的异议合理有据，法院可能会决定不采纳该鉴定意见，并依据其他证据或重新鉴定结果来认定案件事实。

4. 实践中的处理方式：

   • 在实践中，为了避免争议和确保鉴定的公正性，双方当事人往往会在诉讼前或诉讼中共同委托鉴定机构进行鉴定。
   • 如果确实需要单方委托鉴定，建议当事人在委托前与对方进行沟通协商，尽量达成一致意见，并在鉴定过程中保持透明和公正，以减少后续争议的可能性。

法律建议：

• 对于被告而言，如果确实需要单方委托鉴定，应确保选择具有合法资质和良好信誉的鉴定机构，并严格按照法定程序进行鉴定。同时，应保留好鉴定过程的相关记录和材料，以备法院审查。
• 对于原告而言，如果对被告单方委托的鉴定提出异议，应提供充分的证据或理由来支持自己的观点，并积极参与法院组织的质证和辩论过程。
• 在任何情况下，双方当事人都应尊重法院的审查和判断，并依据法院的裁决来履行自己的义务。

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