公司扣签证费用是否合法，需分情况讨论：
若签证费用属于员工因工作需要而产生的必要费用，且公司未提前告知或约定由员工承担：
- 在这种情况下，公司扣除签证费用通常是不合法的。根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位应当为劳动者提供必要的劳动条件，包括因工作需要而产生的相关费用。若公司未提前与员工明确约定此类费用由员工承担，那么在员工实际产生费用后，公司无权单方面扣除。
若公司事先与员工明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定：
- 如果公司在与员工签订劳动合同时，或通过其他合法方式（如规章制度、员工手册等）明确约定了因工作需要产生的签证费用由员工承担，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司扣除签证费用可能是合法的。但即便如此，公司也应当确保约定的合理性，并充分告知员工相关费用承担情况。
若签证费用并非因工作需要而产生，或公司扣除费用缺乏合理依据：
- 如果签证费用并非员工因工作需要而产生的，或者公司扣除费用时缺乏合理依据（如未提供费用明细、未说明扣除原因等），那么公司扣除签证费用是不合法的。员工有权要求公司返还被扣除的费用，并可能因此向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
法律建议：
- 对于员工而言，如果公司扣除签证费用，首先应当查看劳动合同或公司规章制度中是否有相关约定。如果没有约定或约定不明确，员工可以与公司协商解决；如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。
- 对于公司而言，如果确实需要员工承担因工作需要产生的签证费用，应当在劳动合同或公司规章制度中明确约定，并确保约定的合法性和合理性。同时，公司在扣除费用时应当提供详细的费用明细和扣除原因，以避免不必要的法律纠纷。
可能后果：
- 如果公司非法扣除签证费用，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。同时，公司还可能因此承担民事赔偿责任，向员工返还被扣除的费用并支付相应的利息或赔偿金。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。