公司扣身份证是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律角度

根据《中华人民共和国居民身份证法》第十五条第三款明确规定：“任何组织或者个人不得扣押居民身份证。但是，公安机关依照《中华人民共和国刑事诉讼法》执行监视居住强制措施的情形除外。” 公司并非公安机关，也不存在执行监视居住强制措施等法定扣押身份证的情形，因此公司扣押员工身份证的行为违反了该法律规定。

员工权益角度

身份证是公民个人身份的重要证明文件，包含了诸多个人敏感信息。公司扣押员工身份证，会限制员工对身份证的正常使用，比如办理银行业务、乘坐交通工具、入住酒店等，给员工的生活带来极大不便。同时，这也侵犯了员工对个人身份信息的自主支配权，员工有权自由使用和管理自己的身份证。

可能的法律后果

如果公司扣押员工身份证，员工可以向劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权责令公司限期退还员工身份证，并可能对公司处以警告、罚款等行政处罚。若因公司扣押身份证给员工造成损失的，员工还可以要求公司承担相应的赔偿责任。例如，员工因无法及时使用身份证办理重要事务而遭受经济损失，公司应当予以赔偿。

应对建议

如果遇到公司扣押身份证的情况，你可以采取以下措施：

1. 与公司协商：首先尝试与公司进行友好沟通，明确告知公司扣押身份证的行为是违法的，要求公司立即退还身份证。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，提供相关证据，如工作证明、扣押身份证的证明等，劳动监察部门会依法进行调查处理。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：若因公司扣押身份证引发了其他劳动纠纷，如工资拖欠、解除劳动合同等，你可以根据具体情况申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

总之，公司扣押员工身份证是违法行为，员工应当勇敢维护自己的合法权益。如果你还有其他关于劳动工伤方面的法律问题，可以直接向我咨询。