结论：入股合同中约定“离职时1元收购原有股份”的条款，其合法性需结合具体情况分析，不能一概而论。以下从不同角度进行详细阐述：
一、条款合法性的一般分析
合同自由原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人在平等、自愿、公平、诚实信用的基础上，可以约定合同的内容。因此，从合同自由原则出发，双方有权在入股合同中约定离职时股份的处理方式。
条款内容合法性：
- 然而，合同条款的内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。如果“离职时1元收购原有股份”的条款被认定为显失公平、恶意串通损害他人利益或违反其他强制性规定，则该条款可能被认定为无效。
二、条款可能涉及的合法性问题
显失公平：
- 如果该条款是在一方利用对方处于危困状态、缺乏判断能力等情形下订立的，且明显违背公平原则，那么受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。例如，如果员工在入职时被迫接受这一不公平的条款，且该条款显著减轻了公司的责任而加重了员工的负担，那么该条款可能因显失公平而被撤销。
恶意串通损害他人利益：
- 如果该条款是双方恶意串通，以损害公司其他股东或债权人的利益为目的而订立的，那么该条款无效。例如，如果公司大股东与即将离职的员工恶意串通，通过低价收购股份的方式损害其他小股东的利益，那么该条款将因违反法律强制性规定而无效。
违反公司章程或股东协议：
- 如果公司章程或股东协议中另有规定关于股份转让或离职时股份处理的方式，且该规定与入股合同中的条款相冲突，那么需要根据公司章程或股东协议的规定来确定条款的效力。一般来说，公司章程或股东协议对全体股东具有约束力，如果入股合同中的条款与之相悖，则可能因违反公司章程或股东协议而无效。
三、法律建议
审查合同条款：
- 在签订入股合同前，双方应仔细审查合同条款，确保条款内容合法、公平、合理。特别是关于离职时股份处理的条款，应明确约定股份转让的价格、方式、时间等关键要素，以避免后续纠纷。
咨询专业律师：
- 由于股份转让涉及复杂的法律关系和利益调整，建议在签订入股合同前咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供法律建议，帮助双方制定合法、有效的合同条款。
完善公司治理结构：
- 公司应完善治理结构，明确股东权利和义务，规范股份转让和离职时股份处理的方式。通过制定公司章程或股东协议等文件，为股份转让提供明确的法律依据和操作流程。
总结：入股合同中约定“离职时1元收购原有股份”的条款，其合法性需结合具体情况分析。在签订合同前，双方应仔细审查合同条款，确保内容合法、公平、合理，并咨询专业律师的意见。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。