结论：即使合同被销毁，卖家在买家违约且保证金不退的情况下，仍然有可能通过其他证据起诉买家要求赔偿费用。
分析如下：
合同销毁的法律后果：
- 合同销毁本身并不意味着合同关系的消灭或法律责任的免除。合同是双方意思表示的书面载体，但其法律效力并不完全依赖于合同的物理存在。即使合同原件被销毁，如果双方已经实际履行了合同义务，或者存在其他证据能够证明合同的内容和双方的权利义务关系，那么合同关系仍然可以被认定。
违约保证金的性质与处理：
- 违约保证金是买家为了确保履行合同义务而向卖家支付的一定金额。如果买家违约，卖家有权根据合同约定（如果合同存在且有效）或法律规定保留或没收该保证金。然而，即使保证金被没收，这并不影响卖家就买家违约造成的其他损失向买家主张赔偿的权利。
起诉买家的法律依据与证据要求：
- 卖家可以依据《中华人民共和国民法典》中关于合同违约的相关规定，向买家主张违约责任。为了证明买家的违约行为以及卖家因此遭受的损失，卖家需要提供充分的证据。这些证据可以包括但不限于：双方之前的沟通记录（如邮件、短信、微信等）、交易记录、付款凭证、货物交付凭证、证人证言等。
- 即使合同原件被销毁，如果卖家能够提供上述其他证据来证明合同的内容和买家的违约行为，那么法院仍然有可能认定买家的违约责任，并支持卖家的赔偿请求。
实际操作建议：
- 卖家应尽快收集并整理所有与交易相关的证据，包括但不限于上述提到的沟通记录、交易记录、付款凭证等。这些证据将对于证明买家的违约行为和卖家的损失至关重要。
- 卖家可以咨询专业律师（即我本人，张勇律师，专注于刑事辩护、合同纠纷领域），以获取更具体的法律建议和指导。律师将能够根据卖家的具体情况和提供的证据，为卖家制定合适的诉讼策略。
可能遇到的挑战与应对：
- 证据收集难度：由于合同被销毁，卖家可能需要花费更多时间和精力来收集其他证据。然而，只要卖家能够积极行动并充分利用现有资源，仍然有可能收集到足够的证据来支持其诉讼请求。
- 买家抗辩：买家可能会提出各种抗辩理由来否认其违约行为或减轻其赔偿责任。卖家需要准备充分的证据来反驳买家的抗辩，并证明其诉讼请求的合理性。
总结与建议：
即使合同被销毁，卖家在买家违约且保证金不退的情况下，仍然有可能通过其他证据起诉买家要求赔偿费用。为了成功维护自己的权益，卖家应尽快收集并整理相关证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。