在拆迁协议上盖的是村委会的章时，起诉对象的确定应分情况处理：

1. 村委会作为独立实施主体：

   • 若村委会自主决定并执行拆迁工作，包括确定拆迁范围、制定补偿标准等，且独立承担相关权利义务，那么它就是拆迁协议的直接责任方。在这种情况下，如果您对拆迁协议的履行、补偿等问题有异议，应直接以村委会为被告提起诉讼。这种情况多见于农村集体内部的自主改造项目，村委会作为集体组织的代表，有权也有责任处理相关拆迁事宜。

2. 村委会受委托实施拆迁：

   • 若村委会并非拆迁工作的主导者，而是受政府部门或其他拆迁主体（如开发商）的委托进行拆迁工作，那么根据法律规定，受委托组织以委托机关名义实施的行为，其法律责任由委托机关承担。因此，在这种情况下，如果您对拆迁协议有争议，应以委托的政府部门或其他主体作为被告提起诉讼。例如，如果村委会是受某开发商委托进行拆迁，那么开发商就是实际的拆迁责任方，您应起诉开发商。

3. 协议问题或责任不明：

   • 如果拆迁协议本身存在问题，如内容不公平、表述不清晰，或者盖章主体有误等，导致难以准确判断责任主体时，您可以考虑将可能涉及的所有相关方（包括村委会、实际拆迁方等）均列为被告，以便法院在审理过程中查明事实，确定真正的责任主体。这样做虽然可能增加诉讼的复杂性，但有助于确保您的权益得到全面保护。

在处理此类纠纷时，我建议您采取以下措施：

• 收集证据：务必充分收集与拆迁相关的所有文件、沟通记录等证据材料，包括拆迁公告、补偿方案、补偿协议、房屋被拆迁前后的照片或视频等。这些证据将有助于您准确判断责任主体，并为后续的诉讼过程提供有力支持。
• 明确诉讼请求：在提起诉讼时，应明确自己的诉讼请求和理由，例如要求确认拆迁行为违法、履行补偿协议、支付拖欠补偿款或重新分配补偿款等。确保诉讼请求的合法性和合理性，以提高胜诉的可能性。
• 注意诉讼时效：拆迁纠纷的诉讼时效通常为三年，从您知道或应当知道权益被侵害之日起计算。因此，及时采取行动至关重要，以免错过诉讼时效而丧失维权机会。

最后，我想强调的是，拆迁案件往往涉及复杂的法律关系和利益纠葛，因此在处理过程中需要谨慎对待。如果您在处理此类纠纷时遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和帮助。