针对您提出的“合法手续审批就因为邻里纠纷被拒绝发证怎么办”的问题，这确实是一个涉及行政审批与邻里关系处理的复杂情况。以下是我从多个角度为您分析并给出的建议：
了解拒绝发证的具体原因：
- 首先，您需要明确审批部门拒绝发证的具体理由。是因为邻里纠纷直接影响了审批条件（如安全、卫生、规划等），还是审批部门认为邻里纠纷未解决可能引发后续问题？
- 您可以向审批部门要求出具书面的拒绝发证通知书，上面通常会载明拒绝的具体理由和依据。
分析邻里纠纷与审批条件的关联性：
- 如果邻里纠纷与审批条件无直接关联，如仅仅是邻里间的口角或一般性矛盾，那么审批部门以此为由拒绝发证可能缺乏合法依据。
- 如果邻里纠纷确实影响了审批条件，如您的建设行为可能侵犯邻居的合法权益（如采光、通风、隐私等），那么您需要先解决邻里纠纷，确保建设行为符合相关法律法规和规划要求。
采取合法途径解决邻里纠纷：
- 协商：尝试与邻居进行友好协商，寻求双方都能接受的解决方案。
- 调解：如果协商无果，可以寻求社区、居委会或人民调解委员会等第三方机构的帮助，进行调解。
- 诉讼：如果调解也未能解决问题，您可以考虑通过法律途径解决邻里纠纷，如提起民事诉讼或申请仲裁。
针对拒绝发证的行政复议或诉讼：
- 如果您认为审批部门拒绝发证的行为缺乏合法依据或程序不当，您可以考虑提起行政复议或行政诉讼。
- 行政复议：向审批部门的上一级行政机关或同级人民政府提出行政复议申请，要求撤销或变更拒绝发证的决定。
- 行政诉讼：如果行政复议未能解决问题，您可以向人民法院提起行政诉讼，要求法院判决审批部门履行法定职责或撤销拒绝发证的决定。
注意事项：
- 在处理邻里纠纷和行政审批问题时，务必保持冷静和理性，避免采取过激行为。
- 保留好所有相关证据，如审批申请材料、拒绝发证通知书、邻里纠纷的相关证据等，以备不时之需。
- 及时咨询专业律师，获取更具体的法律建议和帮助。
总结来说，面对因邻里纠纷而被拒绝发证的情况，您需要先了解拒绝的具体原因，分析邻里纠纷与审批条件的关联性，然后采取合法途径解决邻里纠纷，并考虑针对拒绝发证的行为提起行政复议或诉讼。在整个过程中，务必保持冷静和理性，保留好相关证据，并及时咨询专业律师。如果您有任何进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请直接向我咨询。