结论：法院在一般情况下不会直接冻结农民工的账户，尤其是在仅因建筑公司套取农民工工资挪作他用这一行为本身，并不直接构成冻结农民工账户的合法依据。但若农民工账户中的资金被认定为与建筑公司的违法犯罪行为有关联，或者农民工本人涉及相关法律纠纷且账户资金可能被转移、隐匿，法院在符合法定程序和条件的情况下，可能会对账户进行冻结。
分析说明：
农民工账户的性质：
- 农民工的工资账户是其个人财产的一部分，受到法律保护。除非有法定事由，否则不得随意冻结或查封。
建筑公司套取工资的行为：
- 建筑公司套取农民工工资挪作他用，这一行为本身主要涉及建筑公司与农民工之间的劳动合同关系或工资支付问题，以及可能涉及的违法犯罪行为（如挪用资金罪等）。但这并不直接构成冻结农民工账户的合法依据。
法院冻结账户的条件：
- 法院冻结账户通常需要满足一定的法律条件，如涉及诉讼、执行等法律程序，且账户资金与案件有直接关联。在建筑公司套取工资的情况下，除非农民工本人涉及相关法律纠纷，或者账户资金被认定为与建筑公司的违法犯罪行为有关联（如资金被混同、无法区分等），否则法院不会直接冻结农民工账户。
可能的法律后果：
- 如果建筑公司套取工资的行为被认定为违法犯罪，且农民工账户中的资金被认定为与该违法犯罪行为有关联，那么法院在符合法定程序和条件的情况下，可能会对账户进行冻结。但这一冻结行为是针对与违法犯罪行为有关联的资金，而非农民工的所有资金。
- 如果农民工因此遭受损失，他们有权通过法律途径追究建筑公司的责任，并要求赔偿损失。
建议与行动：
对于农民工：
- 如果发现自己的工资被建筑公司套取或挪用，应立即向当地劳动监察部门投诉，并保留好相关证据（如工资条、银行转账记录等）。
- 如果账户被错误冻结或涉及相关法律纠纷，应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，并寻求法律帮助。
对于建筑公司：
- 应严格遵守相关法律法规，按时足额支付农民工工资，不得挪用或套取。
- 如果涉及违法犯罪行为，应主动配合相关部门调查，并承担相应的法律责任。
如有任何进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。