结论前置：公司部门解散时，若女员工处于怀孕状态，公司不能直接解除与该员工的劳动合同，而应继续履行合同至相应情形消失，或与员工协商一致解除合同并支付相应补偿。
详细分析：
法律对怀孕女员工的特殊保护：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。这意味着，即使公司部门解散，也不能直接以此为由解除与怀孕女员工的劳动合同。
- 这一规定体现了法律对怀孕女员工的特殊保护，旨在保障她们在特殊时期的合法权益，避免因公司结构调整或经济原因而遭受不公平的待遇。
公司部门解散时的处理方式：
- 继续履行合同：公司应继续履行与怀孕女员工的劳动合同，直至其孕期、产期、哺乳期结束。在此期间，公司应正常支付工资、提供福利待遇，并确保工作环境的安全和健康。
- 协商一致解除合同：如果公司确实面临严重困难，无法继续维持与怀孕女员工的劳动合同，可以与员工协商一致解除合同。但在此情况下，公司应支付相应的经济补偿，并确保员工在解除合同后能够得到合理的安置和保障。
- 经济补偿的计算：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
可能的法律后果：
- 如果公司违反法律规定，直接解除与怀孕女员工的劳动合同，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司继续履行合同或支付赔偿金。
- 赔偿金的标准通常为经济补偿标准的两倍，即公司需支付员工在本单位工作年限对应的两个月工资作为赔偿金（每满一年支付两个月工资，以此类推）。
建议与行动指南：
- 公司层面：在处理部门解散事宜时，应充分考虑怀孕女员工的特殊情况，遵守相关法律法规，避免违法解除劳动合同带来的法律风险和经济损失。
- 员工层面：如果遭遇公司违法解除劳动合同的情况，应及时收集证据，如劳动合同、工资单、解雇通知等，并向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。
示例说明：
假设某公司部门解散，其中有一名怀孕女员工已在该部门工作3年，月工资为5000元。根据法律规定，公司不能直接解除与该员工的劳动合同。如果公司选择继续履行合同，则需支付该员工孕期、产期、哺乳期的工资及福利待遇；如果公司选择与员工协商一致解除合同，则需支付该员工3个月工资（即15000元）作为经济补偿。如果公司违法解除合同，则需支付该员工6个月工资（即30000元）作为赔偿金。
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