结论：员工因保密协议违约，天价违约金远高于员工收入时，法院不一定会完全支持该违约金数额。法院会根据实际情况，综合考虑多种因素来判定违约金的合理性，并可能对过高的违约金进行调整。
分析说明：
法律原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。但是，约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
法院判定因素：
- 实际损失：法院会首先考虑因员工违约给公司造成的实际损失。如果违约金远高于实际损失，法院可能会认为违约金过高。
- 合同履行情况：法院还会考虑合同的履行情况，包括员工在合同履行过程中的表现、是否已经履行了部分义务等。
- 当事人过错程度：员工的过错程度也是法院考虑的因素之一。如果员工是故意违约，法院可能会支持较高的违约金；但如果员工是过失违约，法院可能会适当降低违约金。
- 预期利益：法院还会考虑公司因员工违约而失去的预期利益，但这一利益必须是合理且可预见的。
司法实践：
- 在司法实践中，法院通常会根据上述因素，综合判断违约金的合理性。如果违约金过高，法院可能会根据当事人的请求，对违约金进行调整，使其更加合理。
法律建议：
- 对于公司：在制定保密协议时，应合理设定违约金数额，避免过高或过低。过高可能导致法院不予支持，过低则可能无法起到约束员工的作用。同时，公司应保留好因员工违约造成损失的相关证据，以便在诉讼中证明自己的主张。
- 对于员工：在签订保密协议时，应仔细阅读协议内容，特别是关于违约金的条款。如果认为违约金过高，可以与公司进行协商，争取降低违约金数额。如果发生违约情况，应积极与公司沟通，寻求解决方案，避免诉讼风险。
后续行动：
- 如果您是公司方，且认为员工违约造成的损失与约定的违约金相差较大，可以向法院提起诉讼，请求法院对违约金进行调整。
- 如果您是员工方，且认为约定的违约金过高，可以在诉讼中提出抗辩，请求法院降低违约金数额。
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