关于工厂实行“上4休3”工作制是否会扣工资的问题，结论取决于工厂的具体安排以及是否符合法律法规的规定，以下分情况讨论：

1. 若工厂“上4休3”工作制下，员工每周工作时间未超过法定工时，且工资计算方式合理：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时。若工厂安排的“上4休3”工作制，使得员工每周实际工作时间未超过此标准，且工资计算方式（如按实际出勤天数、小时数计算工资）合理合法，则工厂不应扣减员工工资。
   • 举例：假设员工每周工作4天，每天工作8小时，共计32小时，未超过法定工时，且工资按实际出勤天数计算，则工厂不应扣工资。

2. 若工厂“上4休3”工作制下，员工每周工作时间虽未超过法定工时，但工资计算方式不合理（如固定工资制下无故扣减）：

   • 如果工厂与员工签订的劳动合同中明确规定了工资标准，且该标准未因工作制调整而变更，工厂无故扣减工资则可能构成违法行为。员工有权要求工厂按照合同约定支付工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   • 举例：员工与工厂签订的劳动合同中约定月薪为5000元，工厂因实行“上4休3”工作制而无故扣减工资，员工可要求工厂补足工资差额。

3. 若工厂“上4休3”工作制下，员工每周工作时间超过法定工时：

   • 根据《劳动法》规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。若工厂安排的“上4休3”工作制导致员工每周工作时间超过法定工时，且未支付加班费或未获得员工同意，则工厂可能面临法律责任，同时也不应扣减员工应得工资（包括加班费）。
   • 举例：员工每周工作4天，但每天工作10小时，共计40小时，超过了法定工时4小时。若工厂未支付这4小时的加班费，则员工有权要求工厂支付，并可向劳动监察部门投诉。

法律建议：

• 员工在面对工厂调整工作制时，应仔细阅读劳动合同及工厂的相关规定，了解自己的权益和义务。
• 若对工资扣减有疑问或不满，应及时与工厂沟通协商，要求工厂提供合理的解释和依据。
• 若协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 工厂若违反法律法规规定扣减员工工资，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付工资、加付赔偿金等。
• 员工若因工资扣减问题提起劳动仲裁或诉讼，且胜诉的，工厂还需承担员工因此产生的合理费用（如律师费、诉讼费等）。